常規(guī)小鼠命名方法和規(guī)則當我們在文章里看到C57BL/6,C57BL/6J,BALB/c,BALB/c-nu/nu,F(xiàn)VB等不同命名小鼠,你是否知道它們的差異和聯(lián)系呢,本期的內(nèi)容小編就教教你如何認識五花八門的小鼠命名,定會讓你受益。
題目:我的名字叫C57BL/6J,過年回家我和我堂妹C57BL/6NCrl吃面的時候碰到了表叔C57BL,偷偷的告訴我們,城里當官的堂妹小姨子的嬸嬸的舅姥爺B6會給我們發(fā)紅包。
請問:假如我同學BALB/c和他女朋友C3H結(jié)婚以后生的孩子去Jackson lab工作兩年以后叫什么名字?C57BL、B6、C57BL/6J、C57BL/6NCrl
哇哈哈,是不是有種題目還沒讀完就不知道誰是誰的感覺?心里陰影面積很大嗎?你知道嗎,其實這些字母和數(shù)字組合也都是我們最常見的小鼠模型。在本期結(jié)束以后,你將能夠回答以上問題。
小鼠是生物醫(yī)學研究領(lǐng)域中最常見的動物模型,我們在之前已為大家介紹過常見的大小鼠(鏈接)。上期我們又學習了在動物實驗中應(yīng)該如何善待它們(實驗動物倫理學及福利)。當我們在文章里看到C57BL/6,C57BL/6J,BALB/c,BALB/c-nu/nu,F(xiàn)VB等不同命名小鼠,你是否知道它們的差異和聯(lián)系呢,今天小編就帶你一起來學習,小鼠的命名規(guī)則。
一個標準的命名規(guī)則對于實驗動物的研究有重要意義,但是要完全熟悉不是一件容易的事情,但如果我們能夠了解和掌握小鼠命名的基本規(guī)則,做到顧“名”而思“義”,那將對我們閱讀文獻及合適的動物品系的選擇有很大幫助。目前通用的小鼠命名原則是根據(jù)小鼠標準化遺傳命名國際委員會(International Committee on Standardized Genetic Nomenclature for mice)的規(guī)定。我們主要以此為參考依據(jù),對各種不同品系小鼠的定義和命名規(guī)則做簡要的闡述。
本次內(nèi)容將根據(jù)小鼠的遺傳背景分類來簡單介紹小鼠的命名。
小鼠的分類: 一般生物實驗中要求遺傳背景明確或者來源清楚的動物,用于疾病動物模型主要有近交系、封閉群等。如下為小鼠分類及常見小鼠舉例。
一、近交系
1、一般近交系(Inbred strain)
定義:經(jīng)20代以上同胞兄弟姐妹之間或親代與子代之間的交配培育出來的動物品系,遺傳基因純化度越高,可增加實驗結(jié)果的精確度。
命名:根據(jù)小鼠的來源、歷史及培育經(jīng)過來命名。
類型:
備注:615(F25)表示615小鼠,近交代數(shù)為第25代。
常見近交系的縮寫形式:
1.1 亞系(Substrain)
定義:為近交系的分支,由于殘留雜合基因的分離、基因突變以及在不同地區(qū)繁育而造成同一品系內(nèi)不同分支之間在遺傳上有差異的動物。
命名:母品系(Parent strain)名稱后加一斜線,數(shù)字和培育者的縮寫。
備注:
① 數(shù)字: C57BL/6和C57BL/10 (1937年將C57BL分成2個亞系,即C57BL/6和C57BL/10)
;
② 字母:CBA/J, CBA品系之Jackson實驗室(亞株實驗室標號,通常第一字為大寫)。
③ 數(shù)字及實驗室注冊標號二者混合:當一實驗人員或?qū)嶒炇野l(fā)展出一種以上之亞株時
,如FL/1Re和FL/4Re。
常見的實驗室縮寫:
1.2 支系(subline)
定義:品系的分支,由于形成環(huán)境,母體或細胞質(zhì)的不同,導致可能有遺傳的不同者。
命名:品系或亞系名稱之后加上@標號,其后再加上實驗室注冊號碼。
舉例:
還有用不同的標號表示不同的人為處理方式:
注:但現(xiàn)在已不使用此標示方法,除非它已成為一個確定之品系。
2. 同源突變近交系(Coisogenic inbred strain)
定義:兩個近交系除了在一個確定位點等位基因不同外,其它遺傳基因全部相同。
命名:發(fā)生突變的近交系和突變基因
舉例:
注:小寫字母表示隱性突變,大寫字母表示顯性突變;當突變基因必須以雜合予以形式保持時,用+代表野生型基因,如:A/Fa-+/c。
3. 同源導入近交系(Congenic inbred strain)
定義:是指通過雜交-互交和回交的方式將個體的一個基因?qū)氲浇幌抵,由此形成一個新的近交系。這個新的近交系與原來的近交系只是在一個很小的染色體片段上的基因不同。
命名:
混合近交系:來自2個親代品系,其中一個還未達到近交系狀態(tài)。
命名:其命名是在背景品系名稱之后加上提供品系(donor strain)名稱, 二者間以“;”隔。
舉例:
4. 重組近親系 (Recombinant inbred strain)
定義:由2個近交系雜交,經(jīng)過連續(xù)20代以上兄妹近親交配而得不同的重組近親品系。
命名:母系于前縮寫,中間加上大寫“X”,品系與 X 間無空格,父系于后。
舉例:
二、 F1代雜合子(F1 Hybrids)
定義:兩個不同的近交系動物雜交產(chǎn)生的第一代動物,常用F1來表示。是既具有近交系動物的遺傳特點,又獲得了雜交優(yōu)勢,生命力強,繁殖率高,生長快,體質(zhì)強健,抗病力強等。它與近交系動物有著相同的實驗效果。
命名:母系小鼠加父系小鼠,最后加F1。
舉例:
三、封閉群/遠交群(Outbred stock)
定義:以非近親交配方式(如隨機交配)的培育方法而得到的實驗動物種群,相對于近交系動物其雜合性高,但又有較高的遺傳基因穩(wěn)定性,繁殖力強。
命名:A:B,A為實驗室注冊標號,B為鼠種符號。
舉例:
四、基因突變品系
定義:由于某些動物的基因位點的自發(fā)突變,或人為修飾(基因敲除和敲入),而發(fā)生的一個同類突變品系。此類個體中具有同樣的遺傳缺陷或病癥,如肥胖癥、腫瘤鼠、白血病鼠、糖尿病鼠、高血壓鼠等等。這些品系的動物在醫(yī)學研究中有著極大的應(yīng)用價值。
命名:
自發(fā)突變小鼠:
轉(zhuǎn)基因小鼠:來自Jackson lab的C57BL/6J小鼠被轉(zhuǎn)入人的CD8基因組,轉(zhuǎn)基因是在Jwg實驗室完成,獲取得到的是序號為23的小鼠。
實驗小鼠的命名是一個系統(tǒng)而復雜的工程,其中既有最新概念的更新,也有傳統(tǒng)理念的延續(xù)。我們所做的只是一個簡單的梳理,目的是希望能幫助小伙伴們get到“見到小鼠名字,基本知其含義”的效果,而要想更好地掌握這些知識,那就需要更多的學習和努力咯。
學習了這么多,不知道大家是否可以回答我們開頭的問題呢,可以在下方為我們留言,我們期待你的答案哦!
參考資料:International Committee on Standardized Genetic Nomenclature for mice, 1993