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PNAS | 脂質(zhì)組學(xué)揭示病毒感染引起的脂代謝異常及潛在治療靶點(diǎn)

瀏覽次數(shù):4485 發(fā)布日期:2019-5-16 

關(guān)鍵詞:埃博拉病毒,脂質(zhì)組學(xué),治療靶點(diǎn),脂質(zhì)代謝

2014年,非洲爆發(fā)了有史以來最兇猛的一次埃博拉病毒疫情,震動(dòng)全球。直到年底,疫情才終于得到控制。根據(jù)世衛(wèi)組織的統(tǒng)計(jì)數(shù)字,截至2014年12月14日,全球范圍內(nèi)已有超過1.8萬例感染者,近7000人死亡。因?yàn)橐咔橛绊戅r(nóng)業(yè)生產(chǎn)和貿(mào)易,西非疫區(qū)國(guó)家將有百萬人面臨饑荒威脅。

埃博拉病毒通常通過血液和其他體液等途徑傳播,感染潛伏期從2天到21天不等;颊叩淖畛醢Y狀是突然發(fā)燒、頭痛,隨后是嘔吐、腹瀉和腎 功能障礙,最后是體內(nèi)外大出血,死亡。

今天小編要跟各位老師來聊一聊一篇研究埃博拉病毒的文章。

PNAS

Plasma lipidome reveals critical illness and recovery from human Ebola virus disease

2019

IF=9.504

原文鏈接:https://www.pnas.org/content/116/9/3919

樣本:

45例血漿樣本──11 EVD幸存者(29例血漿樣本),9例死亡者 (9例血漿樣本)和7 例健康志愿者(7例血漿樣本)

技術(shù):

脂質(zhì)組學(xué)技術(shù)

基于脂質(zhì)組學(xué)技術(shù),對(duì)2015年采集到的7例塞拉利昂健康志愿者和確診為EVD患者(11幸存者和9死亡者)及其康復(fù)過程中的一系列血漿樣本(s1,s2,s3)進(jìn)行分析。一共45例血漿樣本,檢測(cè)到包含19種亞類的423種脂質(zhì)分子。

與健康志愿者或死亡者相比,EVD患者的脂質(zhì)代謝發(fā)生了強(qiáng)烈的改變。幸存者與死亡者相比,差異的脂質(zhì)分子逐漸增多,與健康志愿者相比,差異的脂質(zhì)分子逐漸減少,這相反的變化趨勢(shì),暗示幸存者的康復(fù)。

圖1

脂質(zhì)亞類水平上也存在顯著差異,同時(shí)脂肪酸碳總數(shù)、不飽和鍵及單個(gè)脂肪酸的表達(dá)量上也發(fā)生了變化。幸存者的PC亞類含有更長(zhǎng)的多不飽和脂肪酸(平均含有38個(gè)碳和5個(gè)雙鍵),而死亡者的TG亞類含有更長(zhǎng)的不飽和脂肪酸(平均55個(gè)碳和5個(gè)雙鍵) 。

圖2

與健康志愿者或死亡者對(duì)比,幸存者康復(fù)過程中,所有含有16:0 或 18:0的Cer亞類脂質(zhì)分子發(fā)生顯著下調(diào)(>4.5 log2 fold change (FC); P < 0.01),幾乎所有的含有18:3 或20:3 脂肪酸的PI亞類上調(diào)。35%的Cer亞類脂質(zhì)分子, 42%的LPCs亞類脂質(zhì)分子 20%的PCs亞類脂質(zhì)分子,25%的PGs亞類脂質(zhì)分子和50%的PSs亞類脂質(zhì)分子的變化大于4.5倍,表明這些脂類在EVD的感染以及/或恢復(fù)過程中受到顯著影響。

圖3

最后作者進(jìn)一步分析討論死亡者血漿中增加的PS、PE、Cer、PG和DG與幸存者血漿中增加的LPC, PC, LPE和 PI的生物意義,參與細(xì)胞外囊泡、細(xì)胞凋亡、肝功能異常等多種生物過程,并提出了可能提高EVD存活率的干預(yù)治療措施。

圖4

小編心得

生物脂質(zhì),包括甘油酯、甘油磷脂、鞘脂、糖脂等,既是能源物質(zhì),也是生物膜(亞細(xì)胞)的結(jié)構(gòu)與功能基礎(chǔ),同時(shí)也是重要的信號(hào)分子,任何的生物過程都離不開脂質(zhì)的參與,是近幾年代謝組學(xué)領(lǐng)域類非;钴S的一個(gè)研究方向。由于研究的新穎性高,在文章發(fā)表方面具有一定的領(lǐng)先優(yōu)勢(shì)。本篇文章就給出了一個(gè)典型案例,經(jīng)典的脂質(zhì)組學(xué)實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)思路+常規(guī)數(shù)據(jù)分析內(nèi)容+作者的客觀闡述,并刊登在PNAS上,值得各位老師借鑒和參考。

中科新生命脂質(zhì)組學(xué)技術(shù)平臺(tái)建立在LC-MS/MS上,采用包含170萬種脂質(zhì)分子的商業(yè)化LipidSearch數(shù)據(jù)庫(kù),覆蓋8大類脂質(zhì)的鑒定,提供多層次的數(shù)據(jù)分析內(nèi)容(亞類、分子),完整解析脂質(zhì)亞類功能,同時(shí)還提供一站式的脂質(zhì)驗(yàn)證服務(wù)和多組學(xué)聯(lián)合服務(wù)。歡迎各位老師同學(xué)前來咨詢!

來源:上海中科新生命生物科技有限公司
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