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實(shí)驗(yàn)室“標(biāo)配”擬南芥研磨提取核酸引發(fā)的討論

瀏覽次數(shù):4870 發(fā)布日期:2016-12-23  來源:DHS

實(shí)驗(yàn)室“標(biāo)配”擬南芥研磨提取核酸引發(fā)的討論

 

給大家分享的內(nèi)容是——擬南芥研磨提取核酸。

那接下來,就讓我們先睹為快,看看這個(gè)案例的情況。
 
實(shí)驗(yàn):擬南芥研磨提取核酸
 
實(shí)驗(yàn)地點(diǎn):某大學(xué)
 
實(shí)驗(yàn)樣品:擬南芥
 
實(shí)驗(yàn)步驟:
1、在2ml圓底離心管底放入擬南芥樣品,每管樣品量不超過單管體積的1/3;
 
2、在離心管中加入3mm硬質(zhì)不銹鋼研磨珠2顆;
 
3、接下來的步驟根據(jù)提取目的不同操作略有不同,以表格形式展現(xiàn)如下:
 
 
此外,以下我們邀請了提供此案例的嘉賓老師和一些用戶朋友進(jìn)行了分享和討論。
 
嘉賓:大家好,之前跟大家分享過幾期多是動(dòng)物組織,這次我們分享一次植物組織的案例。植物組織的特點(diǎn)是一般樣品量比較大,老師們多會(huì)采用2ml的離心管,每次用適配器的話就是2mlx2X56的研磨量,基本都可以滿足實(shí)驗(yàn)的需求了。
 
嘉賓:之所以想跟大家分享這次的案例,是因?yàn)檫@位老師采用的組織研磨儀研磨方式比較系統(tǒng)全面一些,用組織研磨儀濕磨和冷凍研磨都有。濕磨他通常是在提取DNA的時(shí)候使用,冷凍研磨多用于提取RNA,不知道群里各位老師是否也是采用類似的研磨方式。
 
嘉賓:在這個(gè)案例中,我們看到樣品是擬南芥,像其他的葉片類組織,比如黃瓜、苜蓿、水稻等,都可以采用同樣的設(shè)置進(jìn)行研磨。
 
用戶:DNA和rna的提取條件有什么區(qū)別?
 
嘉賓:RNA的話我們知道比較會(huì)容易降解,所以會(huì)需要浸泡液氮,以及將用具進(jìn)行滅菌,而且盡可能在保證快速短時(shí)間的研磨條件下進(jìn)行。
 
用戶:做過生菜。
 
嘉賓:您可以跟我們分享下您提生菜葉片的條件嗎?是提取RNA還是DNA呢?
 
用戶:液氮手工磨,DNA。上學(xué)時(shí),全是手工配,累死。
 
嘉賓:還好生菜應(yīng)該是屬于容易研磨的類型吧。
 
用戶:玻璃研磨器都沒法用,只能陶瓷的,玻璃直接炸。
 
嘉賓:您可以用一用我們的組織研磨儀。
 
用戶:現(xiàn)在不做了。
 
嘉賓:提DNA的話用自動(dòng)組織研磨儀就可以濕磨,也方便后期離心,不用擔(dān)心轉(zhuǎn)移帶來的污染了。不做了就解放雙手了。
 
嘉賓:一般來說,如果是較有任性的植物組織,比如水稻莖等,對(duì)樣品的進(jìn)入量大小要求會(huì)略嚴(yán)格。
 
用戶:抽提液離心管還不能用滅菌的。
 
用戶:禾本科的植物相對(duì)難磨。
 
嘉賓:如果能盡量將樣品本身剪成1cm長左右的小段會(huì)對(duì)研磨有大幫助。
 
用戶:恩,所以用液氮。
 
嘉賓:是的,您是不是做過類似的植物樣本?
 
用戶:對(duì),我們實(shí)驗(yàn)室只做植物樣品。
 
嘉賓:如果是研磨剛說的韌性含纖維的植物樣本,除了剛老師說的用液氮,也可以同時(shí)采用1大1小的鋼珠來研磨。
 
嘉賓:那您這邊經(jīng)驗(yàn)應(yīng)該比較豐富的,您一般做的都有哪些樣品呢?
 
用戶:我們這一般的植物樣品都有,豆類,玉米,油菜牧草類。
 
嘉賓:樣品種類確實(shí)很多啊。
 
用戶:我們是植物實(shí)驗(yàn)室。
 
嘉賓:一般來說,您覺得哪種比較難磨呢?
 
用戶:我們好多樣品是直接研磨種子,豆類、油菜、苜蓿種子不好磨。
 
用戶:組織研磨儀研磨珠用的什么材質(zhì)的?
 
用戶:我們的組織研磨儀用的是萊馳的mm400,用的是大的不銹鋼珠。
 
嘉賓:用的是不銹鋼的,3mm的鋼珠。
 
用戶:擬南芥是什么東東?
 
嘉賓:實(shí)驗(yàn)用的擬南芥看著還挺可愛的,長在培養(yǎng)皿里,小小的一整片。
 
用戶:植物研究的模式植物。
 
用戶:我還以為是藥材呢。
 
嘉賓:種子的話,用組織研磨儀您一般會(huì)間歇多次研磨嗎?還是說一次性研磨幾分鐘?
 
用戶:玉米及其他相對(duì)容易磨的,一次性一分鐘基本沒問題,豆類和苜蓿種子一般兩三次,但一定先要液氮處理過。
 
嘉賓:是的,種子和我之前說的水稻莖這種一定要液氮過才能出研磨效果。
 
用戶:這就是擬南芥。
 
用戶供圖
 
嘉賓:謝謝史老師,擬南芥植物中的果蠅。對(duì)于難研磨的樣品,我們有時(shí)也會(huì)采用之前說的大鋼珠配小鋼珠的研磨方法,大鋼珠可以把大塊打成小塊,小鋼珠再通過不停的撞擊把樣品研細(xì)。
 
用戶:屬于標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì),具有代表性或者把復(fù)雜物質(zhì)簡單化。樣品的提取效率怎么樣?
 
嘉賓:樣品的提取效率是有保證的,之前也有過案例分享是和手研磨的進(jìn)行比對(duì),效果是比較突出的,一般老師提取之后會(huì)跑一個(gè)電泳,看膠圖的效果,之后在進(jìn)行具體的檢測和下一步工作。上次分享的案例是做藥物代謝分析的,結(jié)果也是讓老師滿意的。
 
嘉賓:樣品的自動(dòng)研磨效果確實(shí)對(duì)后續(xù)提取核酸、蛋白,酶,以及其他成分分析類實(shí)驗(yàn)是很有幫助的
 
用戶:嗯,非常好。
 
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來源:鼎昊源(天津)生物科技有限公司
聯(lián)系電話:010-64838766
E-mail:chenyajing@herosbio.com

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