眾所周知,在DNA、RNA和蛋白質(zhì)的提取過(guò)程中,生物樣本的破碎和勻漿是關(guān)鍵的第一步。誰(shuí)不想來(lái)個(gè)開(kāi)門(mén)紅?當(dāng)然,這并非易事。利用傳統(tǒng)的液氮研磨,不光費(fèi)時(shí)費(fèi)力,效果還不是太穩(wěn)定。尤其在處理多個(gè)樣本時(shí),面對(duì)那一堆研缽,手忙腳亂不說(shuō),交叉污染也是個(gè)不得不重視的問(wèn)題。
世界那么大,你應(yīng)該去看看。如今,機(jī)械的樣品裂解已成為實(shí)驗(yàn)室中首選的樣品制備方法,因?yàn)檫@個(gè)過(guò)程不使用酶、化合物和去污劑,也就避免了下游抑制劑的引入。同時(shí),它也足夠強(qiáng)大,能對(duì)付那些堅(jiān)硬、耐磨和難以處理的樣本。MP Bio的FastPrep-24™ 5G樣品制備系統(tǒng)就是這樣一臺(tái)強(qiáng)勁的儀器。
MP Bio之前已推出多款樣品制備儀器,而FastPrep-24™ 5G是這個(gè)家族的最新成員,5G代表了它是第五代產(chǎn)品。與之前的產(chǎn)品相比,它首次使用觸摸屏界面,操作更為簡(jiǎn)便直觀;同時(shí),動(dòng)力增強(qiáng),處理樣本更加快速。有了FastPrep-24™ 5G,你就能在短短40秒內(nèi)裂解任何難以處理的樣本。
新一代,更厲害
FastPrep-24™ 5G通過(guò)劇烈振動(dòng)樣品管內(nèi)的裂解介質(zhì)(如硅珠、玻璃珠或陶瓷珠)和樣本,來(lái)破壞微生物、動(dòng)物或植物的組織。它采用“8字型”專(zhuān)利運(yùn)動(dòng)方式,可以使樣品管同時(shí)產(chǎn)生旋渦式、振蕩式和抽吸式這三種運(yùn)動(dòng)方式,從而使裂解介質(zhì)珠均勻高效地撞擊樣本,實(shí)現(xiàn)了樣本的充分破碎。與之前的型號(hào)相比,速度從6 米/秒提高到10 米/秒。這下子,再難處理的樣本也不在話(huà)下了。
大家都知道,植物種子是出了名的難搞。種皮中通常含有抑制PCR的單寧,而種子材料則含有淀粉和脂肪,使裂解難以進(jìn)行。而利用FastPrep-24™ 5G裂解40秒后,再用相應(yīng)的試劑盒純化DNA或RNA,即可獲得高產(chǎn)量、高質(zhì)量的核酸,且不含PCR抑制劑、多糖或多酚。整個(gè)過(guò)程也不需要使用有機(jī)變性劑或蛋白酶。
對(duì)于當(dāng)今熱門(mén)的宏基因組學(xué)研究,F(xiàn)astPrep-24™ 5G也能在樣品制備中大顯身手。在研究環(huán)境或腸道樣本時(shí),樣品制備和后續(xù)分離純化非常棘手。通常來(lái)說(shuō),土壤、淤泥和糞便樣本成分復(fù)雜,包括微生物、植物、動(dòng)物組織和其他細(xì)胞,可能含有PCR抑制劑和降解酶。5G儀器能高效裂解各種微生物,包括真菌孢子和內(nèi)孢子、革蘭氏陽(yáng)性菌和酵母。下游結(jié)合使用專(zhuān)門(mén)的土壤試劑盒,可高效分離這些樣本的基因組DNA。
同時(shí),F(xiàn)astPrep-24™ 5G也是首次采用觸摸屏對(duì)儀器進(jìn)行操作控制,提升了操作的便利性。通過(guò)7英寸大的高清顯示屏,你只需輕觸幾下,即可設(shè)置參數(shù),簡(jiǎn)單又直觀。5G中自帶了超過(guò)70種推薦的使用程序。這些程序經(jīng)過(guò)驗(yàn)證,包括所有分析參數(shù),有助于達(dá)到最佳效果。對(duì)于新手而言,這真是個(gè)好消息。當(dāng)然,你也可以保存自定義的程序(最多12個(gè))。
此系統(tǒng)還增加了一些新功能,包括停頓時(shí)間的設(shè)置。在操作過(guò)程中,你可以設(shè)置1-9個(gè)循環(huán),每個(gè)循環(huán)之前可設(shè)1-300秒停頓。這樣,在設(shè)置好之后,整個(gè)過(guò)程能真正做到無(wú)人值守,無(wú)需用戶(hù)干預(yù)。系統(tǒng)自帶USB接口,方便你導(dǎo)出記錄的運(yùn)行數(shù)據(jù)。同時(shí),你也能夠通過(guò)它輕松地升級(jí)軟件。
另外,噪音也是個(gè)不容忽視的問(wèn)題。若儀器噪音大,在處理大量樣本時(shí),對(duì)大家的耳朵都是折磨。FastPrep-24™ 5G的最大噪音低于70 dB,更加安靜,讓你在處理樣本的同時(shí)也能好好地讀文獻(xiàn)。
正確選擇裂解介質(zhì)
這臺(tái)儀器能夠處理各種類(lèi)型的樣本,包括所有類(lèi)型的人類(lèi)、動(dòng)物和植物組織;細(xì)菌、酵母和真菌細(xì)胞,以及環(huán)境和宏基因組樣本。當(dāng)然,樣本有不同,裂解介質(zhì)就要各異。為此,MP Bio準(zhǔn)備了16種裂解介質(zhì),讓你可根據(jù)實(shí)驗(yàn)需要來(lái)靈活選擇。如何選擇?你應(yīng)考慮大小、形狀以及硬度和密度等因素。
大小
研磨顆粒越小,得到的樣本顆粒越小。研磨后得到的樣本顆粒直徑小于研磨顆粒。因此,在選擇裂解介質(zhì)時(shí),應(yīng)考慮你希望得到的樣本顆粒的大小。例如,如果您想得到完整有功能的細(xì)胞器,最好選擇一個(gè)大一點(diǎn)的裂解介質(zhì)。相反,如果是較小的結(jié)構(gòu),如病毒粒子和芽孢,可選擇較小的裂解介質(zhì)。
形狀
形狀也大有講究,它決定了裂解后樣本組分的形態(tài)。球體等鈍的裂解介質(zhì),主要依靠碰撞力來(lái)裂解樣本;而鋒利的裂解介質(zhì)主要依靠剪切力來(lái)裂解樣本。剪切力呢,就像一把雙刃劍,更有利于破碎難裂解的樣本,但也可能會(huì)破壞RNA和一些易降解的蛋白質(zhì)。因此,對(duì)于DNA、穩(wěn)定的蛋白質(zhì)、多糖結(jié)構(gòu)及小分子物質(zhì),剪切力還是很實(shí)用的。
硬度和密度
裂解介質(zhì)的成分決定了兩個(gè)非常重要的參數(shù):硬度和密度。裂解介質(zhì)的的硬度必須比樣本的硬度高,這一點(diǎn),MP Bio的裂解介質(zhì)都能達(dá)到要求,因此密度是一個(gè)重要參數(shù)。密度越大,對(duì)于孢子等難處理樣本的研磨效果越好。此外,裂解介質(zhì)顆粒的密度需要比研磨的溶液更大,否則裂解介質(zhì)漂浮在表面不能發(fā)揮裂解或者勻漿作用。
說(shuō)了這么多,你也許有了大概的印象,但不清楚具體選擇哪一種。沒(méi)關(guān)系,請(qǐng)看下圖,根據(jù)樣本類(lèi)型和應(yīng)用需求進(jìn)行選擇。你可以單獨(dú)購(gòu)買(mǎi)裂解介質(zhì)管,并使用你自己常用的緩沖體系,也可以購(gòu)買(mǎi)整套的純化試劑盒,以獲得最佳效果。裂解管有多種規(guī)格供選擇:2 mL、4.5 mL、15 mL和50 mL管和96孔板。
配合不同樣品數(shù)量、大小和溫度的需求,FastPrep-24™ 5G有11種適配器可供選擇。除了適合室溫下樣品處理的5種適配器,還有3款適配器適合冷凍條件下的樣品處理,這對(duì)于酶活等分析可是福音。冷凍的樣品裂解管裝在適配器上后,可直接在FastPrep-24™ 5G上運(yùn)作,無(wú)需額外的處理。
此外,MP Bio還推出了新型的全金屬適配器,適合高度傳染性的樣本。由于全金屬適配器可耐受450ºC的高溫,因此可通過(guò)高溫和高壓滅菌。在這種情況下包括細(xì)菌、病毒、真菌、寄生蟲(chóng)、類(lèi)病毒、朊病毒都可以被消除。所有的全金屬適配器都可以耐受去垢劑和其他溶劑,容易保養(yǎng)和維修。
配合FastPrep-24™ 5G的使用,MP Bio也提供各種純化試劑盒,用于DNA、RNA和蛋白質(zhì)的提取。根據(jù)樣本種類(lèi)和提取物質(zhì)的不同,試劑盒包含適當(dāng)?shù)牧呀饨橘|(zhì)管、獨(dú)特的緩沖液和純化體系,可快速、重復(fù)地裂解和純化樣本。
如果你手頭剛好有難以處理的樣本,那不妨試試FastPrep-24™ 5G,F(xiàn)在可申請(qǐng)免費(fèi)試用哦,抓緊機(jī)會(huì)。