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生物樣本庫的基礎(chǔ)知識及發(fā)展趨勢

瀏覽次數(shù):21911 發(fā)布日期:2014-6-4  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)
生物樣本庫的基礎(chǔ)知識及發(fā)展趨勢
 
生物樣本庫定義及種類
生物樣本庫又稱生物銀行(Biobank),是按需標(biāo)準(zhǔn)化收集、儲存、處理和/或發(fā)放生物樣本的實(shí)體機(jī)構(gòu)。生物樣本庫涉及的樣本類型及相關(guān)信息主要包括:健康和疾病生物體的生物大分子、細(xì)胞、組織和器官等,如:人體器官組織、全血、血漿、血清、生物體液等;經(jīng)處理的生物樣本(DNA、RNA、蛋白質(zhì)等);生物樣本的臨床、病理、治療、隨訪、知情同意書等資料;生物樣本的質(zhì)量控制、信息管理與應(yīng)用等。
 
生物樣本庫有多種類型,常見的有:組織、器官庫(Tissue bank),如血液庫、眼角膜庫、骨髓庫等;細(xì)胞株(系)庫,包括正常細(xì)胞、遺傳突變細(xì)胞、腫瘤細(xì)胞和雜交瘤細(xì)胞株(系)等。近年來還出現(xiàn)了臍血干細(xì)胞庫、胚胎干細(xì)胞庫等各種干細(xì)胞庫。在人類疾病領(lǐng)域,一些研究單位根據(jù)自身?苾(yōu)勢及特色病種,籌建了各種特色樣本庫,如腸癌庫、鼻咽癌庫、乳腺癌庫、肝癌庫、肺癌庫、食管癌庫、頭頸腫瘤庫、婦科腫瘤庫等。
 
生物樣本庫的意義
隨著后基因組時(shí)代的來臨,對基因的研究引發(fā)了新的研究方法和手段的誕生,密切了基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)與藥物研發(fā)、臨床醫(yī)學(xué)之間的聯(lián)系,使人們可以更準(zhǔn)確地理解環(huán)境和人類遺傳分子之間的相互作用,以期精確地描繪疾病發(fā)生的本質(zhì),從而改進(jìn)目前對于疾病的診斷和治療,由此誕生了從實(shí)驗(yàn)室到病床,把基礎(chǔ)研究所獲得的知識、成果快速轉(zhuǎn)化為臨床上治療的新方法,并通過新方法的實(shí)施反過來驗(yàn)證基礎(chǔ)研究中發(fā)現(xiàn)理論或建立的新的理論,被稱為(B2B,Bench to Bedside)模式,也稱其為轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)(Translational Medicine)。
 
轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)顯著應(yīng)用涵蓋如下兩點(diǎn):
1. 新型的生物標(biāo)志物在臨床疾病檢測中的應(yīng)用;
2. 加快新藥研究的速度。
 
轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)的應(yīng)用離不開基礎(chǔ)研究的成果,這些成果需由大樣本、大數(shù)據(jù)信息的支持。因此,需建立專門的、標(biāo)準(zhǔn)化的生物樣本庫(Biobank),大規(guī)模、高效地搜集和利用生物樣本、生物信息和數(shù)據(jù),保證轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究的需要。這種方式對于提高科研效率有極大的幫助,對于轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)的發(fā)展具有顯著的促進(jìn)作用。
 
生物樣本庫標(biāo)準(zhǔn)化及發(fā)展趨勢
《正如用于功能基因組研究組織生物樣本庫存在的問題-2000項(xiàng)分析》一文中所指出的,目前我國生物樣本庫存在如下問題:
(1)保持方式單一:僅石蠟或液氮;
(2)收集不配對:腫瘤、癌旁、正常;
(3)樣本收集不全面:僅組織或血(全血、血清、血漿),缺乏重要的體液;
(4)臨床信息不完整:缺治療、隨訪;
(5)研究深度、廣度嚴(yán)重受限;
(6)耗材、取樣時(shí)間、運(yùn)輸?shù)任寤ò碎T;
(7)缺乏標(biāo)準(zhǔn)化流程、質(zhì)控、安全保障、信息化管理體系,缺乏專業(yè)隊(duì)伍;
(8)醫(yī)院、科室、內(nèi)專家之間相互封閉、條塊分割;
(引自視為樣本庫最佳實(shí)踐ISBER 2012 資料)
 
基于以上原因,通過調(diào)查走訪,目前國內(nèi)眾多生物樣本庫中,“黃金庫”、“價(jià)值庫”數(shù)量不夠多,同時(shí)還存在一些“垃圾庫”、“死庫”等現(xiàn)象。
 
中國醫(yī)藥生物技術(shù)協(xié)會組織生物樣本庫分會各位專家通過討論,提出了標(biāo)準(zhǔn)化生物樣本庫涵蓋內(nèi)容:
(1)A 理論委員會+ B 知情同意書
(2)C 實(shí)體庫(技術(shù)標(biāo)準(zhǔn)化)組織(癌、癌旁、“正!保、(液氮、福爾馬林等)血清、血漿、全血、胰液、尿糞、胸腹水、CTC、肝細(xì)胞、微生物(細(xì)菌—Hp及耐藥菌株—腸道微生物菌群、病毒等)、細(xì)胞;環(huán)境:水、土壤、農(nóng)作物食品等
(3)D 合格衍生物:DNA、RNA、蛋白、MicroRNA病原體、細(xì)胞等(第三方控制)
(4)E 臨床資料庫(共同臨床信息庫)臨床資料(病史C/A、臨床病理、治療、隨訪)
(5)F 研究數(shù)據(jù)庫——共享機(jī)制
(6)G 轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)(協(xié)同創(chuàng)新與轉(zhuǎn)化)
(引自生物樣本庫最佳實(shí)踐ISBER 2012 資料)
 
進(jìn)入二十一世紀(jì)以來,隨著現(xiàn)代生物科技的快速發(fā)展,分子遺傳學(xué)取得了巨大的發(fā)展,國內(nèi)外對于人類遺傳資源的保護(hù)與開發(fā)研究勢頭強(qiáng)勁,各國科學(xué)家普遍認(rèn)為,生物樣本庫的發(fā)展趨勢應(yīng)具備如下特點(diǎn):
(1)標(biāo)準(zhǔn)化:如通過行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)認(rèn)證、國家標(biāo)準(zhǔn)認(rèn)證、資質(zhì)論證等。
(2)專業(yè)化:生物樣本庫建設(shè)需要由專業(yè)的團(tuán)隊(duì),相關(guān)的課題組及研究院相互合作完成。
(3)特色化:生物樣本庫的建設(shè)不以數(shù)量為原則,而應(yīng)以質(zhì)量為原則,以共享利用為原則。
(4)信息化:充分利用計(jì)算機(jī)技術(shù),網(wǎng)絡(luò)技術(shù),實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)共享,籌建中國虛擬樣本數(shù)據(jù)庫。
(5)集約化:在標(biāo)準(zhǔn)化前提下資源庫的大型化,如第三方存儲中心——生物銀行。
(6)國際化:在生物樣本庫管理教育培訓(xùn)、質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn)等方面實(shí)現(xiàn)國際化。
(7)價(jià)值化:各個(gè)國家內(nèi)部研究機(jī)構(gòu)和國家之間對資源庫的共同建設(shè)和共享,完善充分應(yīng)用機(jī)制。
(8)自動化:高端、高效、高質(zhì)、安全
(引自生物樣本庫最佳實(shí)踐ISBER2012 資料)
 
Hamilton 產(chǎn)品在生物樣本庫領(lǐng)域應(yīng)用
生物樣本庫日常樣本處理工作通常包含如下幾個(gè)部分:(1)生物樣本采集及收集;(2)生物樣本制備,如血液樣本組份分裝等;(3)生物樣本及數(shù)據(jù)信息存儲;(4)生物樣本處理及出庫供給,如核酸提取等。
 
Hamilton 公司成立于1947年,其液體處理工作站的技術(shù)及自動化樣本存儲技術(shù)在全球范圍內(nèi)都處于領(lǐng)先地位。在生物樣本庫應(yīng)用領(lǐng)域,Hamilton 根據(jù)生物樣本庫日常樣本處理工作內(nèi)容,能夠提供一站式解決方案,實(shí)現(xiàn)全部工作流程的自動化。
來源:哈美頓(上海)實(shí)驗(yàn)器材有限公司
聯(lián)系電話:021-6164 6567
E-mail:contact.china@hamilton.ch

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