鎳離子金屬鰲合親和層析介質(zhì)(Ni-NTA)說(shuō)明書
一、 簡(jiǎn)介
金屬螯合親和層析介質(zhì),又稱固定金屬離子親和色譜,其原理是利用蛋白質(zhì)表面的一些氨基酸,如組氨酸能與多種過(guò)渡金屬離子如Cu2+,Zn2+,Ni2+,Co2+,F(xiàn)e3+發(fā)生特殊的相互作用,能夠吸附富含這類氨基酸的蛋白質(zhì),從而達(dá)到分離純化的目的。因此,偶聯(lián)這些金屬離子的瓊脂糖凝膠就能夠選擇性地分離出這些含有多個(gè)組氨酸的蛋白以及對(duì)金屬離子有吸附作用的多肽、蛋白和核苷酸。半胱氨酸和色氨酸也能與固定金屬離子結(jié)合,但這種結(jié)合力要遠(yuǎn)小于組氨酸殘基與金屬離子的結(jié)合力。
鎳NTA親和層析介質(zhì)(Ni-NTA )具有特異性好、流速快的優(yōu)點(diǎn),顆粒粒度均勻,粒徑小,并且螯合鎳更穩(wěn)定,能耐受更高的還原劑,物理和化學(xué)穩(wěn)定性好,批次重復(fù)性好。本產(chǎn)品已經(jīng)螯合好鎳離子,使用更方便。
二、 性能參數(shù):
特點(diǎn) |
基團(tuán)密度高,載量大,分辨率高,使用方便 |
基質(zhì) |
6%的交聯(lián)瓊脂糖凝膠 |
配體 |
Ni2+ |
配體密度 |
20-40μmol /ml |
吸附載量 |
15mg蛋白/ml |
介質(zhì)顆粒大小 |
45-165μm |
最大流速 |
600cm/h |
pH范圍 |
3-10,在位清洗時(shí)pH范圍可到2-11 |
保存溫度 |
+4-8℃ |
保存液體 |
20%乙醇 |
三、 適用范圍
分離帶His標(biāo)簽的重組蛋白及能被金屬離子吸附的多肽、蛋白、核苷酸、磷酸化蛋白。
四、 應(yīng)用實(shí)例
實(shí)驗(yàn)名稱:Ni-NTA 分離帶His標(biāo)簽的重組蛋白
實(shí)驗(yàn)步驟:
1、Ni-NTA 裝柱,1.6×20cm,柱床體積為10ml;
2、用緩沖液1平衡2~5個(gè)床體積,流速為2ml/min;
3、將20ml細(xì)胞破碎液(50mM PBS,pH7.4,0.5M NaCl)0.45μm濾膜過(guò)濾,上樣,流速為1ml/min;
4、用緩沖液1再洗2~5個(gè)床體積,流速為2ml/min;
5、用分別含10、20、50、100、200、300、400mM咪唑的緩沖液3進(jìn)行階段洗脫,流速為2ml/min,收集各階段洗脫峰,用SDS-PAGE檢測(cè)融合蛋白的分子量大小和純度;
6、用純水流洗5個(gè)柱床體積,再用20%的乙醇流洗3個(gè)柱床體積,流速為2ml/min,柱子置于+4-8℃環(huán)境中保存。
緩沖液組成:
緩沖液1:50mM pH7.4的PBS緩沖液。配制:0.5M NaH2PO4 19ml,0.5M Na2HPO4 81ml,NaCl 29.3g, 加適量水溶解后定容到1000ml。
緩沖液2:50mM磷酸鹽緩沖液,pH7.4,即pH7.4的PBS溶液。配制:0.5M NaH2PO4 19ml,0.5M Na2HPO4 81ml,NaCl 29.3g和咪唑34g, 加適量,水調(diào)pH后定容到1000ml。
緩沖液3:不同咪唑濃度的緩沖液B配制:
咪唑濃度 |
緩沖液1量(ml) |
緩沖液2量(ml) |
10 mM |
98 |
2 |
20 mM |
96 |
4 |
50 mM |
90 |
10 |
100 mM |
80 |
20 |
200 mM |
60 |
40 |
300mM |
40 |
60 |
400 mM |
20 |
80 |
SDS-PAGE流程:
1、BCA法測(cè)量樣品蛋白濃度
2、根據(jù)測(cè)定樣品的蛋白濃度,算出5~10μg/孔所需的體積。
3、向1.5ml EP管中加入含5~10μg蛋白的樣品溶液,若體積小于10μl,則加20mM PBS pH7.4補(bǔ)足10μl;若體積大于10μl,則要加入1ml無(wú)水乙醇,-20℃下濃縮1h。
4、取濃縮樣品10000rpm離心15min,除去上清,37℃烘箱10min去除殘余的乙醇。
5、在樣品加入20mM PBS pH7.4和2×loading buffer各10μl,100℃下10min。取出后冷卻30s,4000rpm離心1s。
6、點(diǎn)樣,電泳。
實(shí)驗(yàn)結(jié)果:
(1)使用Ni-NTA Agarose純化His標(biāo)簽重組蛋白
His標(biāo)簽重組蛋白的上樣量為20ml,用分別含20、50、100、200、300、400mM咪唑的緩沖液B進(jìn)行洗脫,色譜結(jié)果見圖1,色譜各組分的SDS-PAGE結(jié)果見圖2。
圖1. Ni-NTA Agarose純化帶His標(biāo)簽重組蛋白色譜圖
圖2. SDS-PAGE 圖譜
1、 標(biāo)準(zhǔn)蛋白, 2、上樣液, 3、流穿液, 4:20mM洗脫液, 5:50mM洗脫液,
6:100mM洗脫液, 7:200mM洗脫液, 8:300mM洗脫液, 9:400mM洗脫液。
(2)使用Ni-NTA Agarose純化His標(biāo)簽重組蛋白包涵體
條件和前面的方法基本相同,只是緩沖液中加了8M的脲,溶液配方如下表,其純化色譜圖和電泳圖分見圖3、圖4。
要注意的是不同的包涵體溶解度不同,也可以用6M鹽酸胍代替8M脲,因?yàn)辂}酸胍溶解包涵體更完全。
緩沖液組成:
緩沖液1:50mM pH7.4的PBS緩沖液。配制:0.5M NaH2PO4 19ml,0.5M Na2HPO4 81ml,NaCl 29.3g 和脲480 g,加熱溶解后定容到1000ml。
緩沖液2:50mMpH7.4的PBS溶液。配制:0.5M NaH2PO4 19ml,0.5M Na2HPO4 81ml,
NaCl 29.3g,咪唑34g和脲480 g,加熱溶解后定容到1000ml。
緩沖液3:不同咪唑濃度的緩沖液B配制:
咪唑濃度 |
緩沖液1量(ml) |
緩沖液2量(ml) |
50 mM |
90 |
10 |
400 mM |
20 |
80 |
圖3. Ni-NTA Agarose純化His標(biāo)簽重組蛋白包涵體色譜圖
圖4.SDS-PAGE圖
1:包涵體,2:流穿液,3:50mM咪唑洗脫液,4:400mM咪唑洗脫液。
(3)不同金屬離子及洗脫條件對(duì)純化效果的影響
使用Ni-NTA Agarose,His標(biāo)簽重組蛋白的上樣量為10ml,用含有20、50、100、200、500mM咪唑的緩沖液3洗脫,緩沖液1和2均加入終濃度為1%的吐溫80,其結(jié)果表明加入表面活性劑可以降低雜吸附。此外分別螯合銅鈷金屬離子做同樣的純化實(shí)驗(yàn),結(jié)果表明在回收率和純度上都以螯合鎳離子的效果最好,其分離純化的純度可以>90%,而目標(biāo)蛋白的回收率高達(dá)80%,所以建議首選鎳離子螯合填料,別的可以不用考慮。
五、 應(yīng)用注意事項(xiàng):
鎳離子金屬螯合親和層析介質(zhì)最經(jīng)典的配體是IDA。鎳離子有六個(gè)螯合價(jià)數(shù),Ni-IDA螯合了三價(jià),剩余三價(jià);而Ni-NTA螯合四價(jià),剩余兩價(jià),因此Ni-IDA瓊脂糖凝膠作用力要比Ni-NTA瓊脂糖凝膠的強(qiáng)。也正因?yàn)檫@個(gè)原因,在同樣條件下Ni-IDA洗雜質(zhì)和目標(biāo)蛋白的要比Ni-NTA的咪唑濃度高,但是NTA的填料更穩(wěn)定,耐受更強(qiáng)的還原劑,更不容易脫落;而IDA的載量要比NTA高,可以反復(fù)利用,更加經(jīng)濟(jì)。具體用哪個(gè)填料完全看個(gè)人的習(xí)慣以及純化的條件而決定。
六、有關(guān)操作說(shuō)明
1、色譜柱裝填
(1)所有需要用到的材料的溫度要與色譜操作的溫度一樣,液體最好做脫氣處理。
(2)在柱下端加入蒸餾水,以除去柱中空氣,關(guān)閉柱出口,在柱內(nèi)保留少量蒸餾水。
(3)將介質(zhì)連續(xù)倒入柱子時(shí),要用玻璃棒緊靠柱子內(nèi)壁引流,以減少氣泡的產(chǎn)生,讓介質(zhì)自然沉降。
(4)柱壓不超過(guò)0.3MPa,如果裝柱系統(tǒng)中無(wú)法測(cè)柱壓,則控制流速高于300cm/h,但是在使用中一般只用最大流速的75%。
2、固定金屬離子
(1)金屬離子的固定必須用過(guò)濾好的金屬離子溶液,以防止金屬鹽在介質(zhì)上沉淀。
(2)用2-5倍柱床體積的蒸餾水充分平衡柱子。
(3)選擇合適的金屬離子(Cu2+,Zn2+,Ni2+,Co2+,F(xiàn)e3+等),溶解在中性或弱酸性的溶液中,濃度為0.1~0.3M。如果是Fe3+必須在低pH下螯合(pH 3),以防止Fe3+產(chǎn)生沉淀。
(4)用2-5個(gè)柱床體積的金屬離子溶液上柱,再用不少于5倍柱床體積的蒸餾水洗滌色譜柱,洗去未螯合的金屬離子。(當(dāng)然也可以把洗凈沒(méi)有螯合的填料直接和需要的金屬離子溶液在搖床上震蕩過(guò)夜,這樣螯合效果更好,Ni-NTA Agarose尤其適合用這樣的方法。)
(5)用2-5倍柱床體積的起始緩沖溶液平衡柱子,再上樣。
(6)如果是螯合鐵離子,要注意的是在中性條件下,F(xiàn)e3+很容易被還原而生成沉淀,所以Fe3+溶液的pH最好是3-5。螯合Fe3+的色譜柱不能長(zhǎng)時(shí)間保存在中性溶液中。建議每次用完后都要將螯合的Fe3+用50 mMEDTA溶液洗凈,下次使用時(shí)再重新螯合。如果洗不干凈,也可以將介質(zhì)浸在50mM的EDTA中過(guò)夜后再清洗保存。
3、上樣
(1)樣品通溶解在pH5.5~8.5的緩沖液中,提高上樣緩沖液的pH值,可以增大載量。
(2)選擇起始緩沖液,主要是依據(jù)金屬離子的特性及樣品與金屬離子的結(jié)合特性。
(3)緩沖液中不能含有EDTA和檸檬酸鹽,也最好不含巰基乙醇等還原劑。
(4)常用緩沖液有10~20m M磷酸鈉鹽緩沖液和50mM醋酸鈉緩沖液
(5)在緩沖液中要加入0.15~0.5M的NaCl,以消除離子交換作用。
(6)使用金屬螯合層析有一個(gè)通常的法則,如果不了解蛋白的結(jié)合特性,建議先選用Zn2+,緩沖液可以選擇中性的磷酸鹽或者醋酸鹽緩沖液,NaCl的含量為0.15-0.5M,作為起始緩沖液。
(7)緩沖液中的去污劑一般不會(huì)影響對(duì)蛋白的吸附作用。
(8)蛋白被吸附時(shí),經(jīng)常會(huì)有一部分的螯合金屬離子被替換,這種現(xiàn)象通常是可見的,尤其是使用有色的金屬離子時(shí),比如Cu2+,所以使用幾次后可以先把金屬離子洗下來(lái),然后再重新螯合金屬離子。
4、洗脫
(1)線性降低或一步降低pH,大多數(shù)蛋白在pH6~4會(huì)被洗脫下來(lái),也可以在pH3~4,緩沖液可以是醋酸鈉、檸檬酸、磷酸鹽緩沖體系。
(2)競(jìng)爭(zhēng)性洗脫:線性增加或一步增加與金屬離子有親和力的物質(zhì),如0~0.5M咪唑,0~50 mM組氨酸,0~2M NH4Cl。梯度洗脫最好在起始緩沖液的恒定pH下進(jìn)行。
(3)EDTA、EGTA等螯合劑會(huì)與金屬離子產(chǎn)生作用力,導(dǎo)致蛋白被洗脫下來(lái),這種方法不能使不同的蛋白分離,此外會(huì)影響蛋白吸附,導(dǎo)致融合蛋白不能掛柱。
(4)所有上述情況中,緩沖液中必須加入0.15~0.5M的NaCl 以消除離子交換作用。
(5)當(dāng)螯合離子配基是Cu2+時(shí),有以下的三種操作方式:
降低pH:
上樣緩沖液:50 mM Na2HPO4, 0.5M NaCl, pH 7.4
洗脫緩沖液:50 mM Na2HPO4, 0.5M NaCl, pH 3.5
競(jìng)爭(zhēng)洗脫:
上樣緩沖液:50 mM Na2HPO4, 1M NaCl, pH 7.4
洗脫緩沖液:50 mM Na2HPO4, 1M NH4Cl, pH 7.4
脫落洗脫:
上樣緩沖液:50 mM Na2HPO4, 0.5M NaCl, pH 7.4
洗脫緩沖液:50 mM Na2HPO4, 0.5M NaCl, 50 mM EDTA, pH 7.4
使用降低pH和脫落洗脫都會(huì)使金屬離子掉下來(lái),下次使用就得重新螯合金屬離子。
七、 再生、清洗、保存
1、凝膠的再生
(1)螯合一種新的金屬離子之前,必須將膠再生。用5~10倍體積的50mM EDTA淋洗柱子,再用2~3倍體積的0.5M NaCl洗掉殘留的EDTA。
(2)金屬離子的重新固定的方法如前文所述。在一些操作中,變性蛋白和脂質(zhì)不能在柱子的再生過(guò)程中被洗脫下來(lái),他們可以通過(guò)在位清洗被除去。
2、在位清洗
(1)除去因離子交換作用吸附的蛋白,用2~3倍柱床體積2M NaCl溶液淋洗柱子,再反向淋洗。
(2)除去蛋白沉淀、疏水性蛋白,用1M NaOH以100cm/h的速度淋洗柱子1h。
(3)所有操作中,都要用至少3倍柱床體積的初始緩沖液洗柱子。
(4)除去強(qiáng)的疏水性蛋白和脂質(zhì)等,用4倍柱床體積的70%的乙醇或者30%的異丙醇洗柱子,再反向淋洗。
八、保存
在20%乙醇中,4℃下長(zhǎng)期保存。