作者:李愛麗等 來源:生物技術(shù)通報(bào)
典型的PCR操作
在此處僅列出—般PCR操作過程,具體影響因素的優(yōu)化將在本章第二節(jié)討論,每一個(gè)具體操作前都需進(jìn)行必要的優(yōu)化。
(一) 試劑
(1)引物根據(jù)待擴(kuò)增DNA不同,引物亦不同,引物的設(shè)計(jì)見本章第三節(jié)。
(2)耐熱DNA聚合酶:此酶是從耐熱細(xì)菌中分離出來的,能耐受高溫(93—100c),
不同耐熱DNA聚合酶的特性詳見本章第4節(jié)。 Perkin—E1mer—cetus公司、
N、F、Bio1ab、PharMacia公司、國內(nèi)華美公司、復(fù)旦.大學(xué)和中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院友誼公司等均有商品供應(yīng)。
(3)10x PCR緩沖液: 500mm01/L KCl; 100mmol/L Tris一HCl(pH8.4, 20c),
150mmol/L MgCl2, lmg/m1明膠o ““
(4)5mmo1/L dNTP貯備液:將dATP,dCTP,dGTPT和dTTP鈉鹽各100mg合
并,加3m1滅菌去離子水溶解,用NaoH調(diào)pH至中性,分裝每份300v1, (-) 20℃保存c
dNTP濃度最好用uv吸收法精確測定。另外,F(xiàn)在已有中性dNTP溶液商品供應(yīng)
(Sigma公司和Pharmacia公司等).
(5)標(biāo)本處理試劑:不同標(biāo)本所需試劑不同,根據(jù)具體情況而定〔見本章第6節(jié))G
(二) 操作程序
利用PcR擴(kuò)增的操作程序基本相同,只是根據(jù)引物與靶序列的不同,選擇不同的反
應(yīng)體系與循環(huán)參數(shù)(見本章第::節(jié))o基本的操作是將PcR必需反應(yīng)成分加入一微量離心
管中,然后置于一定的循環(huán)參數(shù)條件下進(jìn)行循環(huán)擴(kuò)增。每個(gè)實(shí)驗(yàn)室或每個(gè)人都有不同的操
作習(xí)慣,但需遵守一定的操作規(guī)范。我們推薦下述操作程序,因這樣操作可最大程度地增
加反應(yīng)的成功率。
(1)向一微量離心管中依次加入:
ddH2 O補(bǔ)至終體積(終體積50~100ul)
10 x PCR緩沖液 1/10體積
dNTP 各200umol/L
引物 各1umol/L
DNA模板 10*10一10*10*10*10*10拷貝
混勻后,離心15s使反應(yīng)成分集于管底。
(2)加石蠟油50—100ul于反應(yīng)液表面以防蒸發(fā)。置反應(yīng)管于97c變性7min(染色體
DNA)或5min(質(zhì)粒DNA).
(3)冷至延伸溫度時(shí),加入1—5U Taq DNA聚合酶,在此溫度作用1min.
(4)于變性溫度下使模板DNA變性適當(dāng)時(shí)間。
(5)在復(fù)性溫度下使引物與模板雜交一定時(shí)間。
(6)在延伸溫度下使復(fù)性的引物延伸合適的時(shí)間。
(7)重復(fù)(4)一(6)步25—30次。每次即為一個(gè)PcR循環(huán)o
(8)微量瓊脂德凝膠電泳檢查擴(kuò)增產(chǎn)物(見本章第7節(jié))o
上述過程可以用PcR自動(dòng)熱循環(huán)儀進(jìn)行,也可以設(shè)定3個(gè)恒溫水浴鍋手工操作.