Rich information, Deeper Insights - Biacore 結(jié)合動(dòng)力學(xué)在癌癥中的應(yīng)用
韓佩韋, 通用電氣醫(yī)療集團(tuán)生命科學(xué)部產(chǎn)品經(jīng)理
自人類基因組項(xiàng)目完成以來(lái),編碼于基因天書(shū)中的秘密正逐步被揭示,研究人員又面臨著新的巨大挑戰(zhàn)-解讀基因編碼的蛋白質(zhì)之間相互作用所構(gòu)成的復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)。隨著基礎(chǔ)研究和臨床實(shí)踐的開(kāi)展,人們?cè)絹?lái)越清楚的意識(shí)到,生物分子之間彼此高度有序的相互作用,決定了細(xì)胞的命運(yùn),如增殖、分化和死亡。蛋白質(zhì)、核酸之間的相互作用嚴(yán)格的控制著DNA的復(fù)制、RNA轉(zhuǎn)錄、蛋白質(zhì)翻譯、大分子物質(zhì)聚集與降解以及胞內(nèi)的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)網(wǎng)絡(luò)?梢哉f(shuō),分子相互作用是所有生物機(jī)體保持正常生物功能的基礎(chǔ)。而威脅當(dāng)今人類健康的多種疾病,如心腦血管疾病、神經(jīng)退行性疾病、傳染性疾病以及已列為我國(guó)頭號(hào)健康殺手的癌癥,其病因正與機(jī)體內(nèi)生物分子間相互作用的異常改變密切相關(guān)。因此,透徹了解生物分子間相互作用的發(fā)生條件、過(guò)程以及調(diào)控機(jī)制、將有助于闡明疾病發(fā)生的分子機(jī)理并有助于尋找治療的藥物。
干擾或逃避細(xì)胞正常程序性死亡或者凋亡途徑是腫瘤細(xì)胞的一個(gè)特征,它使得腫瘤細(xì)胞在從原發(fā)病灶遷出的轉(zhuǎn)移過(guò)程中得以存活下來(lái)。結(jié)合基因工程與分子生物學(xué)技術(shù),發(fā)現(xiàn)、了解并確認(rèn)那些參與細(xì)胞周期調(diào)控、基因轉(zhuǎn)錄、細(xì)胞分裂與凋亡現(xiàn)象的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑,精確定位那些參與損害壞細(xì)胞正常程序性死亡以及導(dǎo)致凋亡逃逸的蛋白分子的關(guān)鍵調(diào)控基序(motif)和結(jié)構(gòu)域(domain),將有助于發(fā)現(xiàn)針對(duì)乳腺癌[1,4]、前列腺癌[2,3]、卵巢癌[5.6,7]、結(jié)腸癌[8,9]、胰腺癌[10,11,12]等癌癥發(fā)生相關(guān)的生物標(biāo)志物,有助于腫瘤研究人員結(jié)合臨床樣本分析設(shè)計(jì)出有效的診斷試劑和腫瘤拮抗劑。
深入了解腫瘤和癌癥發(fā)生機(jī)理、確認(rèn)和定量臨床樣本中的生物標(biāo)志物(Biomarker)以及基于此進(jìn)行的診斷試劑和藥物開(kāi)發(fā)的過(guò)程非常復(fù)雜[13],通常需要多種技術(shù)的相互驗(yàn)證,如ELISA, 免疫印跡、免疫沉淀、熒光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET)、表面等離子體共振(SPR)、NMR、EMSA(凝膠阻滯電泳)以及質(zhì)譜等技術(shù),尋找相互作用的孤對(duì)配體(Orphan Ligand)[14,15,16]、比較信號(hào)分子以及藥物-靶標(biāo)之間的作用強(qiáng)度、穩(wěn)定性以及在不同內(nèi)環(huán)境下,包括pH值,輔助因子、鹽濃度等情況下分子相互作用的性狀改變。一般來(lái)說(shuō),親和力和IC50通常是研究者所關(guān)注的主要指標(biāo),然而,這些參數(shù)通常是在穩(wěn)態(tài)狀態(tài)下獲得的,而生物分子間隨處可見(jiàn)的相互作用卻是非常動(dòng)態(tài)的,僅僅根據(jù)穩(wěn)態(tài)時(shí)的性狀很多時(shí)候會(huì)忽視多種潛在的藥物候選物或者無(wú)法對(duì)現(xiàn)象進(jìn)行合理的解釋。一種針對(duì)卵巢癌和結(jié)腸癌細(xì)胞過(guò)表達(dá)的HER2/neu致癌基因開(kāi)發(fā)的抗癌的短肽模擬物就親和力而言較其全抗體稍弱,但其在藥靶上的滯留時(shí)間(穩(wěn)定性)卻沒(méi)有減弱,與此同時(shí),由于其較小的尺寸和人源性, 大大降低了后期的免疫原性問(wèn)題[17];通過(guò)干擾Ras蛋白的嵌膜作用,研究者阻斷了由Ras致癌基因介導(dǎo)的級(jí)聯(lián)信號(hào),并可以基于此指導(dǎo)后續(xù)的藥物設(shè)計(jì)[18];通過(guò)點(diǎn)突變蛋白與受體的互作分析,研究者分析了凋亡蛋白與通過(guò)受體介導(dǎo)的兩條通路[19];在酵母雙雜交和免疫共沉淀之后定量驗(yàn)證這些結(jié)論,揭示結(jié)腸癌腺瘤樣息肉蛋白與胞內(nèi)其他蛋白的作用模式[20];發(fā)現(xiàn)信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路中影響正常有
絲分裂的特定蛋白質(zhì)[21];基于DNA突變檢測(cè)癌癥[22];這些都得益于能夠?qū)崟r(shí)、無(wú)需標(biāo)記的分子間互作分析技術(shù),如基于表面等離子體共振技術(shù)的Biacore技術(shù)。
基于表面等離子體共振技術(shù)(SPR)的代表Biacore是最早商業(yè)化的生物傳感器技術(shù),自1990年第一臺(tái)Biacore生物傳感器問(wèn)世以來(lái),便在全球?qū)W術(shù)界和制藥領(lǐng)域獲取了肯定和很高的聲譽(yù),也一直被公認(rèn)是結(jié)合動(dòng)力學(xué)和無(wú)標(biāo)記互作分析技術(shù)的金標(biāo)準(zhǔn)。迄今為止,基于Biacore系統(tǒng)發(fā)表的關(guān)于分子互作方面的文獻(xiàn)已超過(guò)15000篇,占生物傳感器總文獻(xiàn)量的93%以上[23],并以目前大約每年超過(guò)1000篇的速度增長(zhǎng)。Biacore提供的結(jié)合動(dòng)力學(xué)能夠從分子間識(shí)別能力和穩(wěn)定性的角度對(duì)信號(hào)通路組分及藥靶互作的性質(zhì)進(jìn)行表征和優(yōu)化,從而提高藥物特異性、藥效和臨床階段的安全性。結(jié)合動(dòng)力學(xué)以相比于傳統(tǒng)技術(shù)能夠提供更加豐富的內(nèi)涵信息,更深入的定量了解分子互作本質(zhì)的優(yōu)勢(shì)已經(jīng)被用于了解癌癥和腫瘤發(fā)生機(jī)理、臨床診斷試劑、藥物篩選、藥物優(yōu)化以及藥物臨床前以及臨床的安全評(píng)價(jià)中。應(yīng)用結(jié)合動(dòng)力學(xué)(Binding Kinetics)為我們提供豐富的數(shù)據(jù),將改變我們以往可能知其然而不知其所以然的尷尬局面,從而減少臨床診斷開(kāi)發(fā)和新藥研發(fā)中的彎路[24]。
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