1. 在96孔盤中按標準流程培養(yǎng)1.2ml細菌菌液到合適的濃度。(本實驗中,為驗證本方法對每個樣品的平行性,采用培養(yǎng)250ml菌液,然后用96 道移液槍轉(zhuǎn)移1ml到每個孔中)
2. 2,000 x g離心 5 分鐘收集細菌,倒棄培養(yǎng)液。
3. 用96 道移液槍轉(zhuǎn)移170ul Buffer P1/Rnase A至細菌沉淀團中。放置在振蕩儀上,1500-2000rpm振蕩 1-2 分鐘充分重懸細菌。
4. 用 96 道移液槍轉(zhuǎn)移 170ul Buffer P2 至細菌重懸液中。放置在振蕩儀上,300-600rpm振蕩混勻3 分鐘裂解細菌。
5. 用 96 道移液槍轉(zhuǎn)移 170ul Buffer N3 至細菌裂解液中。放置在振蕩儀上,300-600rpm振蕩混勻5 分鐘中和。
6. 放到離心機中。4000-4700g離心 15 分鐘沉淀去除雜質(zhì)。
7. 小心取出96 孔板, 放置在 96 道移液移液槍的平臺中。 調(diào)整好移移槍插入的深度, 吸取450ul上清液至新的96 孔反應板中。(若沉淀較多,可只轉(zhuǎn)移 400ul)
8. 用 96 道移液槍加入 0.5 倍體積的磁珠結合液(Bind Beads)至樣品中。放置在振蕩儀上,1000-1200rpm振蕩混勻1 分鐘。室溫靜置 10 分鐘 (處理低拷貝數(shù)的質(zhì)粒2-8 ℃放置過夜) 。
9. 放置在磁力架上吸附磁珠5 分鐘。用 96 道移液槍吸棄廢液(吸取800ul以上)。
10. 用 96 道移液槍每孔加入600ul 70%乙醇至每一個孔中。放置在振蕩儀上 1000-1200rpm振蕩混勻1 分鐘。
11. 放置在磁力架上吸附磁珠3 分鐘。用 96 道移液槍吸棄廢液(吸取650ul以上)。
12. 用 96 道移液槍每孔加入200ul 70%乙醇。放置在振蕩儀上 1000-1200rpm振蕩混勻1 分鐘。
13. 放置在磁力架上吸附磁珠 3 分鐘。用 96 道移液槍吸棄廢液(吸取250ul以上)。
14. 室溫干燥20 分鐘。
15. 用 96 道移液槍每孔加入50-100ul滅菌水(Elution Buffer),放置在振蕩儀上 1200-2000rpm振蕩混勻2 分鐘。
16. 放置在磁力架上吸附磁珠3 分鐘。用 96 道移液槍轉(zhuǎn)移質(zhì)粒溶液至新的 96 孔板中。