基因芯片篩選發(fā)現(xiàn)乙型肝癌血清血漿microRNA生物標(biāo)志物
瀏覽次數(shù):2525 發(fā)布日期:2011-11-23
來源:上海伯豪生物技術(shù)有限公司
基因芯片篩選發(fā)現(xiàn)乙型肝癌血清血漿microRNA生物標(biāo)志物
肝癌(hepatocellular Carcinoma,HCC)是死亡率僅次于胃癌、食道癌的世界第三大常見惡性腫瘤。目前常用的肝癌診斷方法有影像學(xué)和生物標(biāo)志物法,但是這些診斷方法的靈敏性和準(zhǔn)確率都不夠,以至于只有約30%的肝癌能被早期診斷出來。尋找靈敏高效的肝癌早期診斷方法對于肝癌的治療有重大意義。
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microRNA芯片聚類結(jié)果 |
microRNA在1993年首次被發(fā)現(xiàn)。許多研究表明,在肝癌和癌旁正常組織之間存在microRNA表達(dá)譜的差異。另外,研究發(fā)現(xiàn)在人類血清血漿中存在大量穩(wěn)定的microRNA。這些現(xiàn)象表明,大家可以尋找肝癌患者血清血漿中高含量的microRNA,以此作為生物標(biāo)志物進(jìn)行肝癌的早期診斷。在本文中,科學(xué)家們利用Agilent microRNA芯片篩選、RT-PCR驗(yàn)證等方法尋找到7個(gè)microRNA的組合,這一組合能對乙型肝癌(hepatitis B virus related HCC)患者進(jìn)行早期診斷。相關(guān)成果發(fā)表在2011年11月的《Journal of Clinical Oncology》上。microRNA生物芯片技術(shù)服務(wù)由上海伯豪生物技術(shù)有限公司/生物芯片上海國家工程研究中心完成。
科學(xué)家們首先使用microRNA芯片對比肝癌患者VS正常人群,肝癌患者VS慢性乙型肝炎(chronic hepatitis B,CHB)患者,肝癌患者VS肝硬化(cirrhosis)患者血清血漿microRNA的表達(dá)譜。結(jié)果篩選出15個(gè)明顯差異表達(dá)的microRNA。
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Receiver operating characteristic (ROC) 曲線分析肝癌患者與正常人群之間該組microRNA的表達(dá)差異,AUC值為0.941。 |
隨后科學(xué)家們利用RT-PCR的方法對這15個(gè)microRNA進(jìn)行驗(yàn)證分析,從中篩選出7個(gè)確定差異表達(dá)的microRNA。并利用407份樣品的RT-PCR數(shù)據(jù)建立起了一個(gè)多指標(biāo)的logis>c回歸分析模型,用以區(qū)分肝癌患者和其它對照人群。最后科學(xué)家們又利用390份樣品對建立好的診斷模型進(jìn)行驗(yàn)證。該模型區(qū)分肝癌患者和正常人群的正確率能達(dá)到94.1%。這項(xiàng)研究成果對于肝癌的早期診斷和治療有重大意義。
原文:Jian Zhou, Lei Yu, Xue Gao, Jie Hu, Jiping Wang, Zhi Dai, Jiefei Wang, Zhiyong Zhang, Shaohua Lu, Xiaowu Huang, Zheng Wang, Shuangjian Qiu, Xiaoying Wang, Guohuan Yang, Huichuan Sun, Zhaoyou Tang, Ying Wu, Hongguang Zhu and Jia Fan. Plasma MicroRNA Panel to Diagnose Hepa//s B Virus–Related Hepatocellular Carcinoma. Journal of Clinical Oncology. November 21, 2011(影響因子18.97)