大腸桿菌(E. coli )的核糖體(70S,M=380萬)由50S (M=180萬) 大亞單位及30S小亞單位 (M=90萬)組成,用簡(jiǎn)單的直線型5—25%蔗糖梯度(在緩沖液中調(diào)制)。合適的緩沖液(0.2mM 醋酸鎂,10mM Tris—HCL 及60mM 氯化銨)有利于穩(wěn)定70S核糖體并有利于50S及30S 亞基的分離
設(shè)備:
各型超速離心機(jī)(以日立CP—MX為例)但加/減速速率檔次必須在5/5以上,日立STF2封管器,取出梯度用日立DGF—U與帶流動(dòng)他的分光光度計(jì)配套,自動(dòng)分部收集器等)
轉(zhuǎn)頭:
各種垂直管,角式及水平轉(zhuǎn)頭均可完成此實(shí)驗(yàn),本文以日立P65VT2 垂直管轉(zhuǎn)頭(65000rpm,416000xg,16×5ml)和PS65T水平轉(zhuǎn)頭 (65000rpm,419000xg, 3×5ml)為例
離心管:
P65VT2 5PA 密封管(加滿液體后用日立STF2 自動(dòng)封管器熔封) P65ST 用5PA 薄壁管(梯度液及樣品加至距管口3mm)
梯度液:用緩沖液溶解后調(diào)制5—25%直線型蔗糖梯度(可以用25%,20%,15%,10%,5%,五檔等分總?cè)莘e后在離心管中直立過夜形成連續(xù)梯度),梯度液上鋪0.35 ml 樣品
離心參數(shù):
P65VT2轉(zhuǎn)頭:65000rpm×20分,4℃,加速“5”減速“6”
P65ST轉(zhuǎn)頭:65000rpm×45分,4℃,加速“8”減速“8”
結(jié)果:
1.P65VT2轉(zhuǎn)頭:離心后50S亞基OD峰(260mm)在22%蔗糖梯度附近,峰頂距離離心管口約4.5cm,30S亞基OD峰(260mm)在相當(dāng)于蔗糖梯度16%附近,峰頂距管口約3.2cm
2.P65ST轉(zhuǎn)頭:離心后,50S亞基OD峰(260mm)在17%蔗糖梯度附近,距離離心管口約3.3cm,30S亞基峰頂在13%蔗糖梯度附近,峰尖距管口約2.2cm
相比較P65ST的峰更尖銳,分離效果稍優(yōu)。
討論:也可以用其他轉(zhuǎn)頭,(如P40ST,P56ST水平轉(zhuǎn)頭或其他角式轉(zhuǎn)頭,但綜合比較實(shí)驗(yàn)結(jié)果以P65ST 和P56ST最佳。)
作者:余興明 電話:13764301893,