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質(zhì)粒DNA分離方法比較(以E.Coli為例)

瀏覽次數(shù):3608 發(fā)布日期:2004-11-11  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責任自負
 
 
發(fā)酵后的E.Coli培養(yǎng)液
用低速大容量冷凍離心機,大容量甩平或角式轉(zhuǎn)頭(3000~6000rpm,30~15min)或高速連續(xù)流轉(zhuǎn)頭(10000~18000rpm,流量300~600ml/min)
E.Coli菌體沉淀
用溶菌酶破細胞壁
用表面活性劑破細胞膜(如Triton X-100,SDS等)
大部分染色體DNA粘附在膜蛋白上,用一定濃度的鹽溶液(如1 mol NaCl 或1 mol 醋酸鈉)溶解后臺式高速離心機(Eppendorf管10000rpm,10min)或高速冷凍離心機10000~12000rpm×10min,上清中大部分為染色體DNA,沉淀中含質(zhì)粒DNA,降解的質(zhì)粒DNA,RNA及蛋白質(zhì)
 

在沉淀中加入異丙醇得到粗制的質(zhì)粒DNA
沉淀中加入TE緩沖液(pH8.0)
粗制DNA在-20℃在重力狀態(tài)喜愛沉淀15min以上,高速離心機12000rpm(近15000g)4℃離心5min去上清

用苯酚抽提去蛋白質(zhì)或用分子篩去蛋白質(zhì)

用RNA酶降解RNA
真空中抽去異丙醇,溶液中加入TE緩沖液
過柱(聚丙烯酰胺)RNA留柱,質(zhì)粒DNA過柱
加入E.B及Triton X-100,在CsCl中(預制梯度或平衡等密度離心,自形成梯度)用角轉(zhuǎn)頭,近垂直轉(zhuǎn)頭做超速離心(見文獻10)
較純的質(zhì)粒DNA,但含有5~10%的染色體DNA和降解的DNA片段
剩余的蛋白質(zhì)上浮,RNA沉淀,染色體DNA在離心管中上部形成區(qū)帶,質(zhì)粒DNA在離心管中下部形成純樣品區(qū)帶

密度梯度儀或其他簡易方法從離心管中抽出,經(jīng)過帶流動池的分光光度計后分部收集,從吸光度峰可以判斷質(zhì)粒DNA所在的位置

去CsCl,去其他組分得到高純度質(zhì)粒DNA

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