比較基因組雜交芯片（Comparative Genomic Hybridization Array）、基于芯片的比較基因組雜交（Microarray-based comparative genomic hybridization）或者陣列比較基因組雜交技術(shù)（array comparative genomic hybridization, array CGH）能在全基因組水平、高分辨率基礎(chǔ)上檢測(cè)染色體拷貝數(shù)的變化。

比較基因組雜交（CGH）是上世紀(jì)九十年代初在染色體熒光原位雜交（FISH）技術(shù)的基礎(chǔ)上結(jié)合消減雜交技術(shù)發(fā)展起來的一種分子細(xì)胞遺傳技術(shù)。它不需要對(duì)待測(cè)細(xì)胞進(jìn)行培養(yǎng)，也不必制備特異區(qū)域探針，一次試驗(yàn)即可檢測(cè)全部待測(cè)基因組DNA拷貝數(shù)改變。

傳統(tǒng)的CGH有兩大主要缺陷，一是分辨率不高，大約是5-20Mb，二是常需要高水平的細(xì)胞遺傳學(xué)專家分析雜交結(jié)果,為了克服CGH技術(shù)的不足，研究人員在芯片基礎(chǔ)上建立了新的array CGH技術(shù)。array CGH實(shí)際上有機(jī)地結(jié)合了芯片技術(shù)和CGH 技術(shù)二者的優(yōu)勢(shì), 在保留了CGH 技術(shù)樣本要求低、全基因組快速掃描等優(yōu)點(diǎn)的同時(shí), 解決了敏感性差、自動(dòng)化程度低、操作復(fù)雜等技術(shù)問題。人們發(fā)展了各種平臺(tái)用于支持 array CGH 研究，array CGH通常用于檢測(cè)與癌癥有關(guān)的體細(xì)胞片斷改變，除此之外，還有很多用途，它可以用來測(cè)量癌癥的拷貝數(shù)情況，研究遺傳疾病和進(jìn)化比較。并且可以在臨床上作為診斷的工具。