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                                Western Blot (免疫印記法)常識(shí)問(wèn)答

                                瀏覽次數(shù):6644 發(fā)布日期:2008-4-13  來(lái)源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)
                                1. 什么是western blot?
                                答:WB又稱免疫印記法.是將生物大分子物質(zhì)通過(guò)不同途徑轉(zhuǎn)移到固相載體的過(guò)程。

                                2. western blot 有什么優(yōu)點(diǎn)?
                                答:靈敏,可達(dá)ng級(jí),用Ecl顯色法理論上可達(dá)pg 級(jí)。方便,特異性高。

                                3. western blot 的具體步驟是什么?
                                答:一. 制樣(以提動(dòng)物組織總蛋白為例),
                                1) 組織洗滌后加入3 倍體積PBS,0℃研磨。
                                2) 加入5×STOP buffer
                                3) 180W, 6mins,0℃超聲波破碎
                                4) 5000rpm,5mins 離心,取上清。
                                5) 加入REB(9.5ml加入0.5ml),溴酚藍(lán)(9.5ml加入0.5ml)
                                6) 煮沸,10min
                                7) 分裝,于-20℃保存,用時(shí)取出,直接溶解上樣。

                                二. 電泳(SDS-PAGE)
                                建議欲檢測(cè)抗原10-30kd, 用15%膠;30-100kd, 用10%膠;100-200kd,用7.5
                                %膠。
                                1)配膠(one piece)A.分離膠。單位:ml。Total: 8ml
                                7.5% 10% 15%
                                2×Sep. buffer 4 4 4
                                30% Gel.sol 2.0 2.7 4
                                ddH2O 1.9 1.2 0
                                TEMED 8ul 8ul 8ul
                                10%APS 80ul 80ul 80ul
                                B. 濃縮膠。單位:ml。Total: 3.5ml
                                3%
                                2×Stacking. buffer 1.7
                                30% Gel.sol 0.35
                                ddH2O 1.4
                                TEMED 5ul
                                10%APS 50ul

                                2)點(diǎn)樣。上樣蛋白量不應(yīng)超過(guò)30ug/mm2. (載荷面即:如果你的膠槽是5mm×1mm, 則
                                載荷面為:1mm×5mm=5mm2)

                                3)電泳。開(kāi)始用80V電壓,但是當(dāng)溴酚藍(lán)至分離膠時(shí),用100-120V電壓。

                                4)轉(zhuǎn)移(一塊膠)。
                                A.半干法。
                                a. 取六張濾紙(Bio-Rad,1mm),三張做上層濾紙,三張做下層。其中,
                                上層濾紙一定要比較干凈,無(wú)污染。用前都用Transfer buffer 浸泡至少
                                五分鐘。
                                b. 準(zhǔn)備硝酸纖維素薄膜,用時(shí)先用甲醇浸泡1-3min.倒掉后,再用Transfer
                                buffer 浸泡。
                                c. 做三明治。陽(yáng)極上鋪三張下層濾紙,再浸泡過(guò)的膜,再鋪膠,然后鋪三
                                實(shí)驗(yàn)方法互助區(qū)——蛋白區(qū)
                                張上層濾紙,最后鋪上三張上層濾紙,蓋上陰極。注意每層之間不能有
                                氣泡。膜上用鉛筆畫(huà)出膠的邊緣。標(biāo)上下。
                                d. 轉(zhuǎn)移,0.8mA/cm2-3mA/cm2. 經(jīng)驗(yàn)是:100kd-200kd,用2mA/cm2,2hrs;
                                30-100kd用1.0-2.0mA/cm2,40mins-1.5h;10kd-30kd%用0.5-0.8mA/cm2,
                                15mins-40mins.
                                B.濕法。
                                a. 取四張濾紙,兩張做上層濾紙,兩張做下層。其中,上層濾紙一定要比較
                                干凈,無(wú)污染。
                                b. 準(zhǔn)備硝酸纖維素薄膜,用時(shí)先用甲醇浸泡1-3mins.倒掉后, 再用Transfer
                                buffer 浸泡。
                                c. 做三明治。
                                e. 轉(zhuǎn)移?乖100kd, 先28V轉(zhuǎn)移1h, 然后84V轉(zhuǎn)移14-16h, ≤100kd, 則
                                63V轉(zhuǎn)移4-16h.

                                三 封閉:5%牛奶4℃封閉過(guò)夜,或RT 1hr.

                                四 第一步反應(yīng):5%牛奶或2%BSA稀釋抗體(稱一抗),稀釋比例按抗體說(shuō)明,室溫
                                孵育1hr,

                                五 洗滌:TBST 洗5 mins 3-5 次。

                                六 第二步反應(yīng):將膜跟5%牛奶或2%BSA稀釋的2 抗一起孵育,室溫1hr。

                                七 洗滌:TBST 洗5 mins 3-5 次。
                                八 顯色:

                                4. western blot 所需buffer 的配方是什么?
                                答:主要的buffer有:
                                1) 2×Separation buffer (PH: 8.8)
                                0.75M TRIS.HCl 90.825g
                                0.2% SDS 10ml 20% SDS
                                Total: 1000ml
                                2) 30% gel Solution
                                0.8% kis-aciylamide 0.8g
                                29.2% aciylamide 29.2g
                                Total: 100ml
                                3)10% APS: 0.1g 溶于1.0ml ddH2O.
                                4) 2×Stacking buffer(PH: 6.8)
                                0.2M Tris 15.14g
                                0.2% SDS 1g or 5ml 20% SDS
                                Total: 500ml
                                5) 10×Running buffer(PH: 8.3)
                                250mM Tris 60.55g
                                1.9M Glycine 285.27g
                                1% SDS 20g or 100ml 20% SDS
                                Total: 2 liters
                                6) Semi-dry transfer buffer(PH:8.3):
                                48mM Tris 5.8g
                                39mM Glycine 2.9g
                                0.037% SDS 0.37g
                                實(shí)驗(yàn)方法互助區(qū)——蛋白區(qū)
                                20% MeOH 200ml
                                Total: 1000ml
                                7) Wet transfer buffer 1(PH: 8.3): (20-400kd)
                                50mM Tris 5.8g
                                380mM Glycine 29g
                                0.1% SDS 1.0g
                                20% MeOH 200ml
                                Total: 1000ml
                                8) Wet transfer buffer 2(PH: 8.3) <80kd
                                25mM Tris 5.8g
                                190mM Glycine 29g
                                20% MeOH 200ml
                                Total: 1000ml
                                9) blocking buffer:
                                5% milk 5g
                                TBST 100ml
                                ※:奶粉為脫脂奶粉。
                                10) 10×TBS (PH: 7.6)
                                NaCl 80g
                                Tris 30g
                                Total: 1000ml
                                11) TBST (PH: 7.4)
                                NaCl 25mM
                                Tris 100Mm
                                Tween-20 0.2%
                                Total: 1000ml
                                12) 5×STOP buffer (PH: 6.7)
                                20% Glycerol 100ml
                                10% SDS 50g
                                250mM Tris 15.14g
                                用時(shí)取9.0ml,加入0.5ml β-ME和0.5ml 溴酚藍(lán),可制成sample buffer。

                                5. western blot 常見(jiàn)問(wèn)題有那些?
                                1) 為什么我的細(xì)胞提取液中沒(méi)有目標(biāo)蛋白?
                                答:原因有很多,1 你的細(xì)胞中不表達(dá)這種蛋白質(zhì),換一種細(xì)胞;2 你的細(xì)胞中的蛋白質(zhì)被降解掉了,你必需加入PMST,抑制蛋白酶活性;3 你的抗體不能識(shí)別目標(biāo)蛋白,多看看說(shuō)明,看是否有問(wèn)題。
                                2)我的細(xì)胞提取液有的有沉淀,有的很清亮,為什么呢?
                                答:1 有沉淀可能是因?yàn)槟愕牡鞍讻](méi)有變性完全,可以適當(dāng)提高SDS 濃度,同時(shí)將樣品煮沸時(shí)間延長(zhǎng),2 也不排除你的抗原濃度過(guò)高,這時(shí)再加入適量sample buffer即可。
                                3)我做的蛋白質(zhì)分子量很。10KD),請(qǐng)問(wèn)怎么做WB?
                                答:可以選擇PSQ 膜,同時(shí)縮短轉(zhuǎn)移時(shí)間。也可以將兩張膜疊在一起,再轉(zhuǎn)移。其
                                他按步驟即可。
                                4)我的目的帶很弱,怎么加強(qiáng)?
                                答:可以加大抗原上樣量。這是最主要的。同時(shí)也可以將一抗稀釋比例降低。
                                實(shí)驗(yàn)方法互助區(qū)——蛋白區(qū)
                                5)膠片背景很臟,有什么解決方法?
                                答:減少抗原上樣量,降低一抗?jié)舛,改變一抗孵育時(shí)間,牛奶濃度提高。
                                6)目標(biāo)帶是空白,周?chē)斜尘,是為什么?br> 答:你的一抗?jié)舛容^高,二抗上HRP 催化活力太強(qiáng),同時(shí)你的顯色底物處于一個(gè)臨界點(diǎn),反應(yīng)時(shí)間不長(zhǎng),將周?chē)孜锎呋,形成了空白。將一抗和二抗(jié)舛冉档停蚋鼡Q新底物。
                                7)我的膠片是一片空白,是怎么回事?
                                答:如果能能夠排除下面的幾個(gè)問(wèn)題那么問(wèn)題多半出現(xiàn)在一抗和抗原制備上。
                                1 二抗的HRP 活性太強(qiáng),將底物消耗光;2 ECL底物中H2O2,不穩(wěn)定,失活;3 ECL
                                底物沒(méi)覆蓋到相應(yīng)位置;4 二抗失活。
                                8)問(wèn)我顯影液顯影1分鐘,和5分鐘后,底片漆黑一片,是什么原因呢?
                                答:1可能是紅燈造成的,可以在完全黑暗的情況下操作.看是否有改善.
                                膠片本來(lái)就被曝光了2顯影時(shí)間過(guò)長(zhǎng).
                                9)DAB好還是ECL好?
                                答:DAB 有毒,但是比較靈敏,是HRP 最敏感的底物;
                                ECL結(jié)果容易控制,但被催化時(shí)靈敏度差一點(diǎn),但如果達(dá)到閥值,就特別靈敏,可以檢測(cè)pg 級(jí)抗原。要看你實(shí)驗(yàn)的情況。
                                10)抗原分子量是資料上的兩倍,是怎么回事?
                                答:抗原形成了二聚體。增多巰基乙醇量,煮沸變性時(shí)間延長(zhǎng),可以打開(kāi)二聚體。在上層膠中加入尿素至8M也可以打開(kāi)。
                                11)半干轉(zhuǎn)是否要求膜,濾紙,膠同樣大?
                                因?yàn)槟z大小不一定規(guī)則,膜和濾紙會(huì)大一點(diǎn),那樣會(huì)不會(huì)短路?
                                什么是短路?如何控制和發(fā)現(xiàn)短路呢?
                                答:一般參照膜>= 濾紙> 膠, 就行,
                                你轉(zhuǎn)移前和轉(zhuǎn)移過(guò)程中看看電壓就行,正常的半干是慢慢變高的, 最后結(jié)束時(shí)一般是開(kāi)始的1.5-3倍都是正常的。一般Buffer和濾紙選的對(duì)就不會(huì)短路。
                                12)電泳時(shí)Marker 按說(shuō)明加5ul,但電泳中看不見(jiàn),是失活了嗎?
                                答:加入20ul即可。
                                13)蛋白轉(zhuǎn)移不到膜上,但膠上有,同時(shí)Marker 轉(zhuǎn)上去了,為什么了?
                                答:可能是1樣品濃度過(guò)低2轉(zhuǎn)移時(shí)間不夠,。
                                14) 我的一抗量較少,同時(shí)我也不知道一抗的最佳稀釋比例是多少,怎么做呢?
                                答:確定實(shí)驗(yàn)過(guò)程無(wú)污染后,將含抗體的稀釋液回收,保存于-70℃。最好第一次的濃度做高一點(diǎn),這樣,如果結(jié)果不好,可以嘗試再稀釋。

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