Solexa測(cè)序技術(shù)原理為專利的“可逆性末端終結(jié)反應(yīng)”,提高堿基合成來(lái)進(jìn)行測(cè)序。
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Solexa 高通量測(cè)序技術(shù)服務(wù)
特色
Ø 通量高、效率高、方向多元、精確性高、成本低
Ø 無(wú)需預(yù)先知道模式物種基因組序列、無(wú)須合成探針、可直接進(jìn)行全基因組表達(dá)研究
Ø 不需要實(shí)驗(yàn)假設(shè)的支持
Ø 可以檢測(cè)到單拷貝分子的變化
Ø 沒(méi)有傳統(tǒng)方法的熒光背景噪音的干擾
原理
Solexa測(cè)序技術(shù)原理為專利的“可逆性末端終結(jié)反應(yīng)”,提高堿基合成來(lái)進(jìn)行測(cè)序。四種堿基分別標(biāo)記四種不同熒光,每個(gè)堿基末端被保護(hù)基團(tuán)封閉,單次反應(yīng)只能加入一個(gè)堿基,經(jīng)過(guò)掃描,讀取該次反應(yīng)顏色后,該保護(hù)基團(tuán)被除去,下一個(gè)反應(yīng)可繼續(xù)進(jìn)行,如此反復(fù),得出堿基的精確序列。
服務(wù)流程
Ø 將目的DNA從細(xì)胞中取出,將其打斷成100-200bp大小的片段,再將片段與接頭相連接,然后經(jīng)過(guò)PCR大量擴(kuò)增成DNA簇。
Ø 將帶有接頭的DNA與芯片進(jìn)行綁定。
Ø 將已經(jīng)用熒光標(biāo)記染料標(biāo)記好的核苷和聚合酶加入到單分子陣列中,互補(bǔ)的核苷與核苷酸片段的第一個(gè)堿基配對(duì),在酶的作用下,與引物結(jié)合。
Ø 再經(jīng)過(guò)堿基互補(bǔ)配對(duì),使單鏈延伸,通過(guò)生物發(fā)光蛋白進(jìn)一步檢測(cè)信號(hào)。
提供服務(wù)
Ø 測(cè)序與重測(cè)序
Ø 在DNA水平上:可以對(duì)基因組甲基化進(jìn)行分析; SNP分型研究;大規(guī)模篩查基因突變;對(duì)基因多態(tài)性進(jìn)行進(jìn)一步的判定與探究。
Ø 在RNA水平上:可以對(duì)小RNA片段進(jìn)行掃描、定量與鑒定;對(duì)全基因組進(jìn)行廣譜表達(dá)研究。
Ø 在蛋白質(zhì)水平上:研究蛋白質(zhì)和核酸的相互作用;對(duì)蛋白質(zhì)和核酸進(jìn)行定位研究。
Ø 染色質(zhì)免疫共沉淀測(cè)序(ChIP-Seq):為了獲得全基因組范圍內(nèi)DNA甲基化、組蛋白各種修飾、轉(zhuǎn)錄因子等的高分辨率分布圖,我們可以利用Illumina Genome Analyzer新一代測(cè)序技術(shù),對(duì)染色質(zhì)免疫共沉淀(Chip)獲得的DNA片斷進(jìn)行大規(guī)模測(cè)序,并把所關(guān)注的蛋白的DNA結(jié)合位點(diǎn)精確定位到基因組上。
Ø 數(shù)據(jù)分析