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光纖微珠牛/犬/馬/豬/羊全基因組SNP分型芯片
illumina光纖微珠牛/犬/馬/豬/羊全基因組SNP分型芯片
服務(wù)類別:芯片與生物信息學(xué)總訪問:2670
最后更新:2011-2-25半年訪問:6
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牛全基因組分型芯片(BovineHD Genotyping BeadChip

 該芯片是覆蓋最廣泛的全基因組分型芯片,能夠分析不同牛以及奶牛的遺傳變異,該芯片是illumina公司與世界頂尖的研究牛的來自于,美國農(nóng)業(yè)部農(nóng)業(yè)研究局(USDA-ARS),輝瑞制藥動物遺傳中心(Pfizer Animal Genetics)以及密蘇里大學(xué)(University of Missouri)等在內(nèi)的科學(xué)家合作開發(fā)出來的。該芯片包含了覆蓋牛全基因組的770000個SNP位點。能夠廣泛地運用于牛的全基因組篩選,數(shù)量遺傳性狀的鑒別,評判遺傳優(yōu)勢和牛的生物多樣性。這個8-樣本的芯片,運用Infinium HD Assay,將為牛的全基因組研究提供強有力的解決方案。

 

犬全基因組SNP分型芯片(CanineHD Genotyping Beadchip)

該芯片包含了來源于CanFam2.0 reference sequence的超過170000SNP位點。該芯片是由illumina公司與歐洲的22所大學(xué)共同研發(fā)的,具有高度多態(tài)性和均勻覆蓋全基因組的特點,可應(yīng)用于任何犬類的遺傳變異研究。更為重要的是,該芯片每mb平均包含70個位點。這種高密度的SNP可應(yīng)用于狗的全基因組關(guān)聯(lián)研究和CNV研究。

 
 
平均判讀率                                      >99%
重復(fù)性                                             >99.9%
孟德爾遺傳不一致性                     <0.01%

羊全基因組SNP分型芯片(OvineSNP50 Genotyping BeadChip
OvineSNP50也是由Illumina公司與國際上領(lǐng)先的研究團隊通過iSelect共同研發(fā)的,共包括覆蓋羊全基因組的50,000SNP位點,平均每間隔46kb就有一個SNP位點。可用于不同種類羊的SNP分型研究。一張芯片可同時檢測12個樣本。可應(yīng)用于全基因組育種,數(shù)量性狀遺傳位點等方面的研究。
 
豬全基因組SNP分型芯片(PorcineSNP60 Genotyping BeadChip
PorcineSNP60是由Illumina公司與國際上領(lǐng)先的研究團隊通過iSelect共同研發(fā)的,共包括覆蓋豬全基因組的60,000SNP位點,平均每間隔40kb就有一個SNP位點?捎糜诓煌N類豬的SNP分型研究,如杜洛克豬(Duroc),長白豬(Landrace),皮特蘭豬(Pietran),大白豬(Large White)等。一張芯片可同時檢測12個樣本?蓱(yīng)用于全基因組育種,數(shù)量性狀遺傳位點等方面的研究。
 

馬全基因組SNP分型芯片(EquineSNP50 Genotyping BeadChip

EquineSNP50包含覆蓋15種馬全基因組的54,602SNP位點,平均每間隔43.2kb就有一個SNP位點,所有位點信息均來自國際馬類基因組序列計劃,一張芯片可同時檢測12個樣本。該芯片可廣泛的用于馬的全基因組SNP分型和數(shù)量性狀遺傳位點等方面的研究。

 
SNP位點數(shù)                          777962
每張芯片檢測樣本數(shù)              8
DNA用量                             200ng
分型方法                         Infinium HD Assay
掃描儀                               iScan, HiScanSQ
                      
判讀率                                     >99%
重復(fù)性                                     >99.9%
孟德爾遺傳不一致性             <0.1%
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