發(fā)現(xiàn)Ion Torrent
Ion Torrent, 個人化操作基因組測序儀(PGM™), 是市場上相較其他測序技術,更簡單,經(jīng)濟和具有強大的可擴展性的測序平臺。PGM™臺式系統(tǒng)的設計配合革新性的半導體芯片技術,使整個平臺具有極高的擴展性和快速完成測序的性能。
Ion Torrent 技術通過專有的大規(guī)模并行半導體感應器,對于DNA 擴增時產(chǎn)生的離子流,實現(xiàn)直接和實時的檢測。當試劑通過集成的流體通路進入Ion Torrent半導體芯片中,密布于芯片上的反應孔立即成為上百萬個微反應體系。這種獨特的流體體系,微體系機械設計和半導體的技術組合,使我們得以快速直接的將遺傳信息翻譯成數(shù)碼的DNA測序結(jié)果,得到大量高質(zhì)量的測序數(shù)據(jù)。
個人化操作基因組測序儀,配合Ion Torrent的半導體芯片,反應試劑盒和計算機服務器,數(shù)據(jù)分析套件,提供您最尖端的測序解決方案。
發(fā)現(xiàn)‘擴展’
比擬半導體技術升級的強大擴展性
• 技術的基礎以超過千億美金規(guī)模的半導體產(chǎn)業(yè)為支持
• 芯片密度的提升以40年來累積驗證的摩爾定律為證據(jù)
• 芯片產(chǎn)量的擴展以四百家標準化半導體生產(chǎn)企業(yè)為選擇
發(fā)現(xiàn)‘簡捷’
簡單真實的生物化學原理
• 真實的離子流測序原理
• 無修飾的核酸,無需酶化學級聯(lián),無需任何熒光和化學發(fā)光
• 經(jīng)濟的標準試劑
發(fā)現(xiàn)‘快速’
直接,實時的測序技術
• 實現(xiàn)更多的研究和市場應用
• 快速的運行時間提速研究周期和文章的發(fā)表
• 革新性的半導體測序芯片,無需光學檢測和掃描
測序和分析流程
Ion Torrent 測序流程標準的要素包括,從準備隨機片段的DNA 文庫或者擴增子文庫,到樣本的PCR 擴增和在PGM™的測序運行。
完成整個PGM™的測序運行后,數(shù)據(jù)將會自動的導入專用的Torrent 預裝分析套件的計算機服務器。在這里,原始的測序信號會轉(zhuǎn)化成堿基序列并且以工業(yè)標準的SFF或者FASTAQ格式存儲起來。這些測序數(shù)據(jù)可以通過眾多商業(yè)化的軟件進行后續(xù)不同應用的分析或者全新基因組的拼接。
A. DNA/RNA 樣本
B. 相應的文庫準備
C. 測序樣本準備
D. 測序反應
E. FASTQ 數(shù)據(jù)格式的測序結(jié)果
Torrent 數(shù)據(jù)分析軟件
Ion Torrent PGM 到 Torrent 服務器和數(shù)據(jù)庫 到終端用戶電腦
Ion 314 測序芯片
芯片規(guī)模: |
130萬個反應微孔 |
數(shù)據(jù)輸出: |
以超過1千萬高質(zhì)量測序數(shù)據(jù)為起始 |
測序長度: |
以100個堿基為起始 |
數(shù)據(jù)格式: |
SFF/FASTQ 數(shù)據(jù)格式 |
試劑: |
314 芯片試劑套裝,包括文庫,樣本和測序試劑 |
應用: |
微生物基因組測序和重測序,靶標(擴增子)區(qū)域重測序 |
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