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NextSeq 500系統(tǒng)集高通量測序的性能和臺式測序儀的簡約為一體,是目前唯一一款可實現(xiàn)外顯子組、轉錄組和全基因組測序的臺式測序儀。它可在兩種模式下開展測序實驗:高產(chǎn)量(High Output)和中等產(chǎn)量(Medium Output),在單次運行中可獲得20-120 Gb的數(shù)據(jù),為您帶來廣泛的應用靈活性。
與MiSeq一樣,NextSeq 500的整個流程也非常簡單。制備好的文庫可直接上樣到系統(tǒng)。整合的簇生成實現(xiàn)了單分子的自動化克隆擴增。產(chǎn)生的DNA簇在NextSeq 500系統(tǒng)上測序,利用Illumina邊合成邊測序(SBS)技術及專利的可逆終止子原理。憑借成熟的SBS技術,NextSeq 500系統(tǒng)帶來了行業(yè)領先的測序準確性,其中75%以上的測序堿基都高于Q30。
Illumina對MiSeq的定位是聚焦通量(Focused power):快速簡約,適合靶向和小型基因組測序;NextSeq 500是靈活通量(Flexible power):快速簡約,適合每日基因組學;而HiSeq 2500是生產(chǎn)通量(Production power):強大高效,適合大規(guī)模基因組學。
全基因組測序
單次運行可開展多少大型基因組測序實驗(人類基因組,30倍覆蓋度)
• MiSeq:不適用
• NextSeq 500:1
• HiSeq 2500:1-10
單次運行可開展多少小型基因組測序實驗(5 Mb微生物基因組,如大腸桿菌,30倍或以上覆蓋度)
• MiSeq:1-96
• NextSeq 500:120-792
• HiSeq 2500:96-6660
外顯子組測序
單次運行可開展多少外顯子組測序實驗(讀長2 x 150 bp)
• MiSeq:1
• NextSeq 500:3-9
• HiSeq 2500:96
參考《NextSeq 500 System Exome Solution Application Note》
RNA測序
單次運行可開展多少基因表達譜分析實驗(每個樣品10M reads)
• MiSeq:1-2
• NextSeq 500:13-40
• HiSeq 2500:60-400
單次運行可開展多少轉錄組測序實驗(每個樣品50M reads)
• MiSeq:不適用
• NextSeq 500:2-8
• HiSeq 2500:12-80
參考《NextSeq 500 System RNA-Seq Solution Application Note》