血液作為臨床研究中重要的研究標(biāo)本,具有易于采樣、安全性高、蛋白分子含量豐富、可反映機(jī)體生理和病理狀態(tài)等特點(diǎn),在疾病早期診斷、預(yù)后指導(dǎo)等生物標(biāo)志物研究方面具有重要的研究價值。隨著質(zhì)譜技術(shù)的發(fā)展,基于質(zhì)譜的血液高通量蛋白質(zhì)組學(xué)正逐漸成為研究血液蛋白質(zhì)的強(qiáng)有力的技術(shù)方法,在腫瘤研究,免疫疾病,心血管代謝性疾病,生殖領(lǐng)域等均成為不可或缺的研究工具。近幾年血液蛋白質(zhì)組的發(fā)文數(shù)量也呈逐年上升的趨勢。
但是血液由于其蛋白分布動態(tài)范圍廣(跨越10個數(shù)量級)、蛋白含量分布不均勻(高豐度占了絕大部分比例、低/超低豐度蛋白占比非常少),且質(zhì)譜的靈敏度有限的原因(目前不做處理的質(zhì)譜檢測范圍仍然高及中豐度蛋白為主),因此蛋白組學(xué)方法對血液蛋白,尤其是發(fā)揮功能性作用的低豐度蛋白的檢測存在著極大的挑戰(zhàn)性。
現(xiàn)中科新生命推出多維立體血液蛋白質(zhì)組學(xué)方案:血液超大隊(duì)列蛋白質(zhì)組、血液外泌體蛋白質(zhì)組、血液 N-糖肽蛋白質(zhì)組以及靶向 OLink 蛋白質(zhì)組,從蛋白、修飾、外泌體等多個研究維度提供全方位解決方案。今天主要講的就是中科新生命推出的血液蛋白質(zhì)組的新產(chǎn)品----深度血液4D-DIA蛋白質(zhì)組。那這款產(chǎn)品是什么呢?主要的特色哪些呢?下面跟隨小編一一揭曉。
實(shí)驗(yàn)流程圖
02 產(chǎn)品特色
·高深度:1500-2000+超高深度中低豐度蛋白鑒定
目前對于血液蛋白的深度質(zhì)譜分析,主要方法是通過去血清高豐度和分級的方式,小樣本規(guī)?蓪(shí)現(xiàn)較高的深度鑒定,但是樣本數(shù)量達(dá)到上百例后,對于實(shí)驗(yàn)流程和質(zhì)譜上機(jī)的穩(wěn)定性提出了更高的要求。對于既能滿足鑒定深度又能兼顧大隊(duì)列的穩(wěn)定性的需要,一直是我們追求的方向。中科新生命新推出的深度血液4D-DIA蛋白組采用最新的富集方法+DIA全息掃描+ Spectronaut 16權(quán)威分析軟件,實(shí)現(xiàn)了血液中低豐度蛋白的超高深度鑒定。
中科新生命內(nèi)測數(shù)據(jù)如下所示,通過樣本制備方法的優(yōu)化、質(zhì)譜方法以及數(shù)據(jù)分析全流程的全新升級,單個血液樣本可以突破1500個蛋白的鑒定,最高鑒定數(shù)量接近2800,大大提升了血液蛋白的檢測深度,且低豐度蛋白的覆蓋程度達(dá)到90%以上,非常適合臨床研究中對于血液深度鑒定的需求。
每例血液樣本的鑒定能力
鑒定能力統(tǒng)計(jì)及低豐度蛋白的覆蓋率
·中低豐度蛋白功能分布在神經(jīng)、炎癥、心血管等各大研究領(lǐng)域
除鑒定深度以外,大家一定對檢測到的蛋白種類和功能感興趣,中科新生命對檢出的中低豐度蛋白參與的生物學(xué)KEGG通路進(jìn)行分析,結(jié)果顯示其覆蓋了神經(jīng)、心血管、炎癥、腫瘤等各個領(lǐng)域的多種關(guān)鍵通路,因此無論您的樣本是用于腫瘤領(lǐng)域標(biāo)志物研究、慢性疾病的發(fā)病進(jìn)程研究,或是感染性疾病、神經(jīng)精神類疾病的研究等,深度血液4D-DIA蛋白組均可以實(shí)現(xiàn)無偏向性的血液蛋白的覆蓋。
中低豐度蛋白功能分析
·血液大隊(duì)列研究優(yōu)選方案:兼具超高穩(wěn)定性與重復(fù)性
中科新生命自推出DIA蛋白質(zhì)組學(xué)產(chǎn)品已來,已助力客戶發(fā)表DIA 項(xiàng)目文章超10篇,且建立了從色譜、質(zhì)譜等多維質(zhì)控體系,保證結(jié)果的高穩(wěn)定性和高重復(fù)性。深度血液4D-DIA蛋白質(zhì)組也采用DIA全息掃描模式,同樣具有超高的穩(wěn)定性和重復(fù)性。
中科新生命的實(shí)測數(shù)據(jù)顯示,三次技術(shù)的定性重復(fù)性達(dá)90%,定量相關(guān)性達(dá)0.9,在色譜穩(wěn)定性的評價中,多維度質(zhì)控均達(dá)到了高標(biāo)準(zhǔn)的水平,進(jìn)一步證實(shí)了結(jié)果的穩(wěn)定性和可靠性。此外,深度血液4D-DIA蛋白質(zhì)組與其他傳統(tǒng)血液蛋白組學(xué)的方法比較分析,也顯示出了其高穩(wěn)定性的特色。如下圖所示,傳統(tǒng)去高豐度+DIA蛋白組的方法鑒定到的蛋白中約86%的蛋白均可在深度血液4D-DIA中檢測到。
重復(fù)性和穩(wěn)定性分析
中科新生命自從推出DIA蛋白組學(xué)以來,已經(jīng)完成了10000+樣本的質(zhì)譜檢測,且樣本類型涉及血液、動植物組織、外泌體等多種類型,項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)豐富,F(xiàn)中科新生命助力發(fā)表的DIA文獻(xiàn)已達(dá)10篇有余,部分DIA客戶文獻(xiàn)請見下表。