近日,我們針對親水和MIX兩大體系完成了升級,隨機對血清、尿液、動物組織、植物組織等多種樣本類型進行了實測。
升級后的「發(fā)現代謝組學HD-親水版」,物質檢出數量平均為升級前的241%,物質定性數量為139%。以人血清樣本為例,物質檢出數量平均提升了96%,物質定性數量平均提升了29%。
升級后的「發(fā)現代謝組學HD-MIX版」,物質檢出數量平均為升級前的193%,物質定性數量為134%。以小鼠血清樣本為例,物質檢出數量平均提升57%,物質定性數量平均提升75%。
B(i)級別可靠鑒定代謝物20%
配合最新優(yōu)化升級的數據庫,參考2021年最新NATURE METHODS(IF=28.547)[1]對代謝物的鑒定級別進行了注釋,「發(fā)現代謝組學HD」系列產品各種類型樣本B(i)級別鑒定代謝物平均占比可達到20%。基于非靶向技術的核心優(yōu)勢,隨著數據庫的迭代升級,可以對已檢出的數據進行反復挖掘,對未知物進行更深度的注釋及提高物質鑒定的可靠性。
(P.S.BIOTREE對「發(fā)現代謝組學HD」系列產品提供免費數據再次挖掘服務)
發(fā)現代謝組學HD兩大升級
1. 儀器性能的提升
使用Thermo Orbitrap Exploris 120高分辨質譜儀器平臺,在性能和質量精度方面都有很大提升,從而采集到更多的代謝物信號。
2.數據庫的升級
為了充分利用代謝組學數據,我們需要在不同的實驗室之間進行可比性?紤]到不同技術手段產出的數據存在差異,在發(fā)表的論文中,需要標明物質注釋的相關信息,其中代謝物注釋的可靠等級尤為重要,BIOTREE對數據庫進行了全面的升級提供了代謝物注釋的分類等級,「發(fā)現代謝組學HD」系列產品可以提供達到B(i)級別的代謝物鑒定。
參考上文提到的NATURE METHODS建議,代謝物鑒定級別:
A 標準品靶向驗證或NMR鑒定
B(i) 基于標品數據庫MS/MS 的可靠匹配
B(ii) 基于模擬數據庫 MS/MS 的可靠匹配
B(iii) 基于MS/MS 的部分匹配
C(i ) 基于標品數據庫MSn 的可靠匹配
C(ii) 基于模擬數據庫 MSn 的可靠匹配
C(iii) 基于 MSn 的部分匹配
D 基于MS的匹配
參考文獻
[1] Alseekh S, Aharoni A, Brotman Y, et al. Mass spectrometry-based metabolomics: a guide for annotation, quantification and best reporting practices. Nat Methods. 2021 Jul;18(7):747-756. doi: 10.1038/s41592-021-01197-1. Epub 2021 Jul 8. PMID: 34239102.