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10x Chromium X系列百萬單細(xì)胞系統(tǒng)重磅上線!

瀏覽次數(shù):7707 發(fā)布日期:2021-8-10  來源:本站 本站原創(chuàng),轉(zhuǎn)載請(qǐng)注明出處

近年來,單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)的迅速發(fā)展和應(yīng)用推廣,為科研人員從多維度揭示生物發(fā)育、腫瘤發(fā)生發(fā)展、感染與免疫,以及藥物研究等領(lǐng)域的科學(xué)問題提供了有力的工具。而在目前商業(yè)化的高通量單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)之中,10x Genomics的Chromium平臺(tái)是應(yīng)用最為廣泛的解決方案,助力國(guó)內(nèi)外的科研、轉(zhuǎn)化和應(yīng)用機(jī)構(gòu)來解決復(fù)雜的生物學(xué)問題,從而改善人類健康。Chromium單細(xì)胞解決方案可從基因表達(dá)、染色質(zhì)可及性、細(xì)胞表面蛋白、免疫克隆型、抗原特異性以及CRISPR編輯等多個(gè)角度解析生物復(fù)雜性,實(shí)現(xiàn)真正的單細(xì)胞多組學(xué)分析。

 

10x Genomics的經(jīng)典款儀器Chromium Controller,輕巧便攜,是您實(shí)驗(yàn)室自用、外出服務(wù)的必備神器,而于2020年推出的自動(dòng)化建庫工作站Chromium Connect,從細(xì)胞懸液到可用于測(cè)序的文庫,可最大限度地減少不同用戶、不同樣品甚至不同地點(diǎn)的單細(xì)胞數(shù)據(jù)差異,大大提高實(shí)驗(yàn)室效率。

 

 

然而,隨著單細(xì)胞測(cè)序的不斷發(fā)展,研究人員對(duì)能夠分析數(shù)十萬甚至數(shù)百萬細(xì)胞大規(guī)模研究的需求不斷增加,如研究免疫學(xué)和傳染病反應(yīng),對(duì)大腦和神經(jīng)系統(tǒng)等極其復(fù)雜的系統(tǒng)進(jìn)行深入分析,對(duì)整個(gè)發(fā)育階段的細(xì)胞類型進(jìn)行完整的圖譜分析,以及大規(guī)模單細(xì)胞 CRISPR 和藥物篩選等。而更高通量的研究往往耗時(shí)耗力、費(fèi)用高昂,因此,如今10x Genomics Chromium X系列解決方案應(yīng)運(yùn)而生。

 

 

10x Genomics Chromium X是一種新型高通量單細(xì)胞測(cè)序文庫構(gòu)建解碼系統(tǒng),單次最多運(yùn)行上百萬細(xì)胞,可大大降低檢測(cè)成本。那么它是怎么做到的呢,數(shù)據(jù)表現(xiàn)又如何?別著急,我們將通過Q&A形式為您一一揭曉~

 

10x Chromium X如何實(shí)現(xiàn)單次運(yùn)行百萬單細(xì)胞?

與10x 之前推出的兩款儀器Chromium Controller和Chromium Connect相同,最新推出的Chromium X系列產(chǎn)品也是基于Next GEM技術(shù)研發(fā),其核心之處在于采用先進(jìn)的微流控技術(shù),可在幾分鐘內(nèi)完成成千上萬個(gè)單細(xì)胞微滴生成和條形碼標(biāo)記,而每個(gè)微滴都含有一個(gè)可識(shí)別的條形碼,便于下游分析。

而與之前的Controller和Connect兩款儀器的8通道,每個(gè)通道最多捕獲10,000個(gè)細(xì)胞不同的是,X儀器有16個(gè)通道,每個(gè)通道最多捕獲20,000個(gè)細(xì)胞,再結(jié)合10x的CellPlex多樣本混樣技術(shù),每個(gè)通道最多可捕獲60,000個(gè)細(xì)胞,去除雙細(xì)胞率后,每張芯片最多可捕獲750,000個(gè)單細(xì)胞。

 

10x Chromium X系列儀器有幾款,有什么區(qū)別?

10x Chromium X系列儀器有兩款,iX和X,兩款儀器外觀相同,但性能不同。X是最全能的一款儀器,從低通量LT到標(biāo)準(zhǔn)通量Standard到高通量HT全部兼容,具有超高的靈活性,無論是入門級(jí)的試點(diǎn)研究,還是進(jìn)行大規(guī)模的超高通量實(shí)驗(yàn),都能完美兼容,并可運(yùn)行多種應(yīng)用如單細(xì)胞基因表達(dá)、免疫分析、ATAC及Multiome;iX可謂是X的入門款,兼容LT和Standard,可通過購買升級(jí)包直接升級(jí)到X,進(jìn)而運(yùn)行高通量試劑盒HT,實(shí)現(xiàn)單次運(yùn)行百萬細(xì)胞。當(dāng)然,iX比X價(jià)格更低,是一種經(jīng)濟(jì)實(shí)惠的選擇。

 

單次實(shí)驗(yàn)這么高的通量,成本究竟能降低多少?

10x Chromium X搭配高通量的試劑盒HT,可使總體實(shí)驗(yàn)成本降低70-80%,單個(gè)細(xì)胞的成本降低多達(dá)7倍!

 

使用10x Chromium X儀器的數(shù)據(jù)表現(xiàn)怎么樣?


1. 
在Chromium Controller和X兩款儀器上運(yùn)行標(biāo)準(zhǔn)通量產(chǎn)出數(shù)據(jù)對(duì)比

10x使用Standard標(biāo)準(zhǔn)通量的試劑盒分別在Chromium X和Chromium Controller上進(jìn)行了不同應(yīng)用(單細(xì)胞基因表達(dá)、免疫分析、ATAC及Multiome)的內(nèi)部測(cè)試實(shí)驗(yàn),兩者產(chǎn)生的數(shù)據(jù)非常相似,說明標(biāo)準(zhǔn)通量的試劑在兩款儀器上運(yùn)行可產(chǎn)生基本一致的實(shí)驗(yàn)結(jié)果。

2. 在10x Chromium X儀器上運(yùn)行標(biāo)準(zhǔn)通量和高通量試劑產(chǎn)出數(shù)據(jù)對(duì)比

10x使用 Chromium X 和新 HT 試劑盒進(jìn)行了一項(xiàng)內(nèi)部研究,以評(píng)估 7 種不同的藥物化合物對(duì) 2 種非小細(xì)胞肺癌細(xì)胞系隨時(shí)間的影響。結(jié)合CellPlex 技術(shù),將來自相同處理的樣品進(jìn)行混樣處理,并在Chromium X 上運(yùn)行單細(xì)胞基因表達(dá)Standard和 HT 兩種解決方案。基因中位數(shù)和UMI檢出率以及UMAP圖中的聚類分析均表現(xiàn)出高度相似,二者的t-SNE投影圖也高度重疊。

然后用基因表達(dá)數(shù)據(jù)來注釋細(xì)胞群,主要的細(xì)胞亞型如 B 細(xì)胞、T 細(xì)胞、自然殺傷細(xì)胞和單核細(xì)胞,以及健康的肺細(xì)胞和腫瘤細(xì)胞,都可以很好地鑒定區(qū)分。疊加抗體數(shù)據(jù)后,健康的肺細(xì)胞如肺泡上皮細(xì)胞和纖毛細(xì)胞,在 HT 和標(biāo)準(zhǔn)方案中都能檢測(cè)到。但綠色的 ELF3+/EPCAM+ 細(xì)胞群僅存在于 HT得到的數(shù)據(jù)中,而單獨(dú)使用Standard方案無法檢測(cè)得到。說明高通量和標(biāo)準(zhǔn)通量可產(chǎn)生可比擬的數(shù)據(jù)結(jié)果,但高通量解決方案比標(biāo)準(zhǔn)通量更能檢測(cè)出稀有細(xì)胞類群。

 

10x Chromium X可以用于哪些應(yīng)用方向?

10x新的Chromium X 和單細(xì)胞高通量 HT 解決方案能夠在廣泛的研究領(lǐng)域?qū)崿F(xiàn)新的應(yīng)用。從對(duì)不同患者群體的深度免疫組庫分析,到在癌癥樣本中尋找超稀有的腫瘤細(xì)胞,到構(gòu)建復(fù)雜的大腦和神經(jīng)系統(tǒng)的綜合圖譜,再到大規(guī)模的單細(xì)胞 CRISPR 篩選和藥物鑒定等。

10x Chromium X系列單細(xì)胞系統(tǒng)可以根據(jù)您需要的實(shí)驗(yàn)規(guī)模開展任何10x Genomics單細(xì)胞實(shí)驗(yàn),并具有業(yè)界最高的通量靈活性,可分析數(shù)百至百萬級(jí)的細(xì)胞。俗話說早就是優(yōu)勢(shì),早點(diǎn)邁入單細(xì)胞研究的新臺(tái)階,解鎖10x Chromium X為您帶來的無限可能,也就把握了高通量單細(xì)胞研究的先動(dòng)優(yōu)勢(shì)。X系列現(xiàn)已接受預(yù)定,早預(yù)定早發(fā)貨,欲購從速!

 

關(guān)于怡美通德

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