高靈敏度的variant檢測現(xiàn)在可以通過使用SPT Labtech的mosquito HV genomics和dragonfly discovery系統(tǒng)進行自動化建庫,將反應(yīng)體系微縮化,減少試劑使用量,降低1/10的成本,從而能夠在一組樣本中添加更多的replicates,提高建庫成功率和測序數(shù)據(jù)質(zhì)量。
此項方案將首先支持用于Illumina系統(tǒng)的Invitrogen Collibri全基因組測序文庫制備試劑盒,以及Collibri文庫定量試劑盒,包括SARS-CoV-2研究、癌癥研究中拷貝數(shù)變異以及其他突變檢測的應(yīng)用。
一、更高的效率
SPT Labtech的mosquito HV genomics和dragonfly discovery系統(tǒng)可以快速編程,24/7全天候進行樣本制備工作,解放研究人員的時間。
二、更高的成功率
使用SPT Labtech設(shè)備進行微縮化建庫,可將試劑的用量體積減少多達10倍,從而可以用不到1個樣本的成本,做5–6個replicates。樣本重復(fù)數(shù)量的增加,保障了即使某個樣品在flow cell上測序失敗,仍有其他樣品的數(shù)據(jù)可以使用,無需再重新準(zhǔn)備樣本展開測序,從而確保了實驗一次成功。Invitrogen Collibri NGS文庫制備試劑盒中每種試劑含有一種示蹤染料,通過顏色變化可清晰觀察文庫制備過程,避免高代價的實驗失誤。
三、更微量的樣本
SPT Labtech設(shè)備獨有的固相置換技術(shù)可以精確地處理微量液體,對0.5uL的粘稠樣本都有著極高的加樣精度。Invitrogen Collibri全基因組測序文庫制備試劑盒可從1 ng的樣本起始量提供均勻的基因組覆蓋度。Collibri ES DNA PCR-free建庫方案經(jīng)過優(yōu)化,可將 100 ng DNA 制備成足量測序文庫,足以用于文庫定量及在 Illumina NovaSeq 系統(tǒng)上進行兩次以上測序。PCR-free的建庫流程可在1.5小時內(nèi)完成,一天內(nèi)就可以將DNA轉(zhuǎn)化為數(shù)據(jù),從而最大限度地提高實驗效率。
四、加速科學(xué)發(fā)現(xiàn):提高實驗成功率并降低研究成本
SPT Labtech的產(chǎn)品戰(zhàn)略總監(jiān)Joby Jenkins表示,在不犧牲結(jié)果質(zhì)量的前提下降低NGS建庫成本是朝著科學(xué)民主化邁出的一大步。NGS技術(shù)發(fā)展迅速,對于每個實驗室來說,將最新的建庫方法進行自動化的流程搭建將會非常耗時,而我們的目標(biāo)就是實現(xiàn)NGS建庫過程的自動化和微縮化,解決技術(shù)和方法上的挑戰(zhàn),這樣科學(xué)家們就可以更關(guān)注于科學(xué)問題本身,擴大他們研究項目的范圍,最終對生命科學(xué)和人類健康產(chǎn)生更深刻的見解。