12月13~14日,第四屆國際精準醫(yī)療產(chǎn)業(yè)論壇在深圳隆重召開。Namocell有幸參與本次盛會,并在多組學與醫(yī)學轉化研究分論壇上作了精彩的單細胞專題報告。
在本次會議的報告中,Namocell向來賓分享了單細胞測序相關技術的發(fā)展,并介紹了Namocell單細胞分離儀在該領域中的最新應用數(shù)據(jù)結果,并取得了熱烈的反響。
在單細胞RNA測序領域,目前有三種常用方法:其一是以10x Genomics為代表的微滴(droplet-based)測序;其二是以Namocell為代表的PCR板(plate-based)測序;其三是以BD Rhapsody為代表的微孔(micro-well-based)測序。
微滴方法的操作較簡單通量較高,但缺點是每個細胞可獲取的基因數(shù)量低,通常在1到3千個基因左右,并且只能測到3’端順序,而不能做到全長測序。PCR板方法的通量沒有微滴方法高,但有幾大優(yōu)勢:
1、可以有選擇性進行單細胞測序,提高了測序效率;
2、每個細胞可獲取的基因數(shù)量高,通常高達1萬個基因以上;
3、可以做RNA全長測序。微孔方法還比較新,通量高但是技術上有些受限,包括細胞間RNA的交叉污染等問題還有待解決。
Namocell單細胞分離儀是基于PCR板方法的最高效,最簡便的獲取單細胞的儀器。Namocell通過微流控芯片將所需要的單個細胞分選出來,在PCR板的小管中進行單細胞cDNA放大及合成。這不但能夠?qū)毎麡颖具M行特異性篩選,也能夠在測序中獲得更大的數(shù)據(jù)量,最終極大的提升了測序數(shù)據(jù)的質(zhì)量。
眾所周知,目前單細胞測序領域最大的挑戰(zhàn)是成本太高。美國麻省理工學院的測序中心采用Namocell單細胞分離儀進行單細胞的測序,使原先25微升的反應量降低至1.2微升,使成本降低了20倍。該測序中心主任Stuart Levine博士在2019年10月的美國人類遺傳學會(American Society of Human Genetics)的年會中做了主題報告,分享了如何用Namocell單細胞分離儀降低反應體積,以降低單細胞測序成本。
Namocell已經(jīng)跟一些相關公司開展合作,正致力于在單細胞測序領域提供全面解決方案,為用戶提供更方便,更低成本的服務。