SX-8G IP-Star®緊湊型全自動(dòng)系統(tǒng)
Diagenode公司專注于高質(zhì)量生物樣品的制備和致力于研發(fā)最先進(jìn)的實(shí)驗(yàn)方案。處理DNA,染色質(zhì)或RNA樣品,從中獲得合適的片段大小是很多實(shí)驗(yàn)至關(guān)重要的技術(shù)流程。 Diagenode公司開(kāi)發(fā)的水槽式超聲破碎儀(Bioruptor®系列制備150bp - 2KB),一個(gè)獨(dú)特的臺(tái)式超聲波設(shè)備(ONE®制備150bp - 1KB)和一個(gè)獨(dú)特的流體剪切儀(megaruptor®制備2KB的- 75kb)基本涵蓋了目前的應(yīng)用范疇。Bioruptor® Plus專門(mén)設(shè)計(jì)用于ChIP-PCR,同時(shí)具備普通超聲破碎儀的所有功能(勻漿組織、破碎細(xì)胞、抽提蛋白等),Bioruptor® Pico 設(shè)計(jì)為六萬(wàn)赫茲的頻率,特別適合核酸小片段化,用于ChIP-Seq和NGS。對(duì)于目前方興未艾的三代測(cè)序,需要更長(zhǎng)的核酸片段來(lái)支撐,這就是Megaruptor®的設(shè)計(jì)初衷,Megaruptor®剪切獲得的大片段DNA響應(yīng)實(shí)驗(yàn)要求,片段分布集中。ONE®是新的桌面解決方案,利用特殊的玻片式容器裝載微量核酸樣品直接置于超聲源上,剪切高效快速,一體化的臺(tái)式設(shè)計(jì),為NGS樣本前處理創(chuàng)新出另一條理想方法。
為了滿足當(dāng)前表觀遺傳學(xué)相關(guān)的各種實(shí)驗(yàn)亟待高通量流程化的迫切要求,Diagenode公司開(kāi)發(fā)了SX-8G IP-Star®緊湊型全自動(dòng)系統(tǒng),該系統(tǒng)提供多重靈活的參數(shù)設(shè)定用來(lái)滿足各種復(fù)雜的實(shí)驗(yàn)條件。簡(jiǎn)單易用的觸摸屏允許多參數(shù)并行操作,處理后的樣品能夠兼容qPCR儀、微陣列和二代測(cè)序等后期處理,同時(shí)儀器本身可以全自動(dòng)完成 ChIP和DNA 甲基化操作。該平臺(tái)靈活多樣,不僅用來(lái)二代測(cè)序文庫(kù)準(zhǔn)備還可用于樣品純化。鑒于SX-8G IP-Star®高度的自動(dòng)化流程,無(wú)人值守,最大化避免操作人員干預(yù),最大限度地保證了數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性和重復(fù)性。
一、主體部件
1、8個(gè)獨(dú)立磁性液體分注頭:高通量,同時(shí)可做1~48個(gè)樣本,可快速處理不同的表觀遺傳學(xué)處理程序,進(jìn)行精確的試劑配置,試劑分注,樣本混合,磁珠吸附,樣本清洗與純化等步驟,沒(méi)有人為的操作誤差,保證具有卓越的重復(fù)性。其中的磁力架可分離磁珠式試劑盒中的磁珠與試劑,可減少磁珠式試劑盒自動(dòng)化機(jī)械操作的繁瑣
2、觸控式液晶屏幕操作系統(tǒng):不需連接計(jì)算機(jī),操作方便
3、96孔板放置架及吸管尖放置架:可精確固定96孔板與吸管尖的位置,讓磁性液體分注頭在移動(dòng)時(shí)更精確移液分注
4、兩組96孔PCR管升降溫模塊:滿足表觀遺傳學(xué)實(shí)驗(yàn)步驟中需要嚴(yán)格控溫的需求,可獨(dú)立升降溫,儀器可同時(shí)處理需要不同溫度處理的樣本或試劑,大量節(jié)省操作的時(shí)間
5、廢棄吸管棄置槽:可自動(dòng)回收廢棄的吸管,避免交叉污染
二、主要技術(shù)指標(biāo)
1、儀器主要功能為進(jìn)行表觀遺傳學(xué)樣本前處理,內(nèi)含預(yù)設(shè)各種表觀遺傳學(xué)實(shí)驗(yàn)程序,自動(dòng)進(jìn)行ChIP實(shí)驗(yàn)及DNA甲基化實(shí)驗(yàn),二代測(cè)序文庫(kù)建立以及其他相關(guān)實(shí)驗(yàn)
2、至少含8個(gè)獨(dú)立液體分注頭,可隨著不同的表觀遺傳學(xué)處理程序,進(jìn)行試劑配置,試劑分注,樣本混合,磁珠吸附,樣本清洗與純化等步驟,而且至少一次可處理8~16個(gè)表觀遺傳學(xué)樣本,以96孔板模式依次進(jìn)行磁珠活化,雜交,清洗,純化等步驟
2.1 分注頭的分液體積范圍:5-200μl
2.2 分注頭分液精確性:5-9μl: < 20%;10-20μl: < 5%;21-200μl: < 2%
2.3 分注頭上需有磁力架裝置,可分離磁珠式試劑盒中的磁珠與試劑,減少磁珠式試劑盒自動(dòng)化機(jī)械操作的困難度
2.4 具防滴漏裝置,預(yù)防儀器運(yùn)做過(guò)程中液體滴落造成污染
3、觸控式液晶屏幕操作系統(tǒng),無(wú)需計(jì)算機(jī)操作簡(jiǎn)便
4、儀器可兼容一般性耗材,包括:
4.1 圓底96孔板
4.2 帶濾芯吸管;8或12連排PCR管
4.3 大型試劑容器
4.4 中型試劑容器
4.5 2ml離心管等
5、儀器中需含兩個(gè)96孔PCR管的升降溫模塊,而且每個(gè)升降溫模塊可獨(dú)立控溫,適合不同的表觀遺傳學(xué)實(shí)驗(yàn)需求,其中:
· 升降溫模塊的升降溫范圍:4°C-95°C
· 模塊的升降溫速度的升溫速度:+0.12°C/sec
降溫速度:-0.08°C/sec
· 模塊升降溫的準(zhǔn)確性:±0.2°C
6、具廢棄吸管棄置槽,可放置程序進(jìn)行中產(chǎn)生的廢棄吸管及液體
7、開(kāi)放式的程序平臺(tái)允許修改流程參數(shù),便于優(yōu)化各種實(shí)驗(yàn)方案
8、一體式設(shè)計(jì),規(guī)矩緊湊,上拉門(mén)設(shè)計(jì),節(jié)約實(shí)驗(yàn)室空間
9、Magtration®技術(shù):SX-8G IP-Star®緊湊型全自動(dòng)系統(tǒng)同樣采用磁珠分離的原理。吸附染色質(zhì)或DNA的磁珠在強(qiáng)大的磁場(chǎng)下被粘附在吸頭的內(nèi)壁上,這完全不同于收集DNA于反應(yīng)池底部的其他品牌,基于此創(chuàng)新,保證了DNA樣本更純凈同時(shí)減少DNA樣本不必要的損耗。
三、配置列表
No |
Description |
Quantity |
Remarks |
1 |
SX-8G compact Main Unit |
1 |
|
2 |
Grip of Front Door |
1 |
w/ two fixing screws |
3 |
96 Tip Rack |
4 |
|
4 |
Reagent Reservoir Rack |
1 |
|
5 |
Reagent Tip Rack 1 |
1 |
for 1.5/2.0ml tubes |
6 |
Reagent Tip Rack 2 |
1 |
|
7 |
Waste Tip Box |
1 |
|
8 |
Waste Chute |
1 |
|
9 |
Stylus Pen |
1 |
|
10 |
Stylus Pen Holder |
1 |
|
11 |
AC240V Power Cable |
1 |
|
12 |
AC110V Power Cable |
1 |
|
13 |
O-ring |
8 |
|
14 |
Silicon Grease |
1 |
For O-rings |
15 |
Fuse |
1 |
|
16 |
Users Manual (J, E) |
1 |
This book |
17 |
Package Check List |
1 |
|
四、儀器用途
· Chromatin immunoprecipitation (ChIP)
· Methylated DNA Immunoprecipitation (MeDIP)
· Hydroxymethylated DNA Immunoprecipitation (hMeDIP)
· Methyl-binding domain protein capture assays (MethylCap)
· Sequential ChIP (Re-ChIP)
· Bisulfite conversion
· DNA purification (IPure)
· Library preparation for Next generation sequencing (NGS) platforms