羅氏NimbleGen DNA甲基化序列富集產(chǎn)品在中國(guó)上市
瀏覽次數(shù):86423 發(fā)布日期:2014-3-25
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甲基化研究方法的革新-羅氏NimbleGen SeqCapEpi產(chǎn)品在中國(guó)上市
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圖:NimbleGenSeqCapEpi甲基化片段富集實(shí)驗(yàn)流程,先“亞硝酸鹽處理”后“捕獲測(cè)序”、正負(fù)雙鏈同時(shí)捕獲,提升測(cè)序數(shù)據(jù)有用性及結(jié)果正確性。實(shí)驗(yàn)僅需1微克 DNA樣本,全基因組水平分析僅需1/4 HiSeq 200測(cè)序lane測(cè)序量 |
羅氏NimbleGen公司最新上市的SeqCapEpi基因組DNA甲基化序列富集產(chǎn)品,結(jié)合二代測(cè)序,可以進(jìn)行在單堿基分辨率的樣品甲基化分析。該產(chǎn)品系列包括:固定內(nèi)容的、人類全基因組水平的可甲基化位點(diǎn)的DNA片段富集方案;以及,適合于各種不同應(yīng)用的由客戶自選區(qū)域的目標(biāo)序列富集產(chǎn)品。該產(chǎn)品系列可以為表觀遺傳研究人員提供全新的研究工具,相比現(xiàn)有其他技術(shù),可以在更大DNA序列廣度,更高測(cè)
序深度和更大樣本量水平下進(jìn)行DNA甲基化研究。
DNA甲基化已被證明能在多種生物過程中起到重要作用,包括基因表達(dá)、劑量補(bǔ)償(dosage compensation)、基因組穩(wěn)態(tài)等等。在最近幾年,其在癌癥和許多其他疾病相關(guān)領(lǐng)域中,已越來越受到關(guān)注。而目前的研究工具,在進(jìn)行全基因組或基因組區(qū)段研究時(shí),或是效率有限、價(jià)格昂貴,或是存在實(shí)驗(yàn)偏好。NimbleGen依托其探針設(shè)計(jì)和生產(chǎn)技術(shù)的優(yōu)勢(shì),通過與一些表觀遺傳學(xué)研究專家的合作,開發(fā)了SeqCapEpi甲基化片段富集產(chǎn)品,旨在大幅研究提高效率和準(zhǔn)確性,幫助科研人員進(jìn)行廣泛的發(fā)現(xiàn)性應(yīng)用,以及定向性的DNA甲基化研究。
阿爾伯特愛因斯坦醫(yī)學(xué)院表觀遺傳學(xué)中心主任John Greally博士,是NimbleGen產(chǎn)品開發(fā)過程中的重要合作者之一,他介紹說:“NimbleGen的技術(shù)可以幫助克服一些在DNA甲基化分析中的難點(diǎn)。利用SeqCapEpi定制設(shè)計(jì),使我們能夠更有針對(duì)性地、對(duì)我們正在研究的細(xì)胞系中的甲基化相關(guān)區(qū)域進(jìn)行研究,充分利用來自ENCODE及Roadmap Project中的基因表達(dá)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)信息。這使我們能夠充分利用測(cè)序數(shù)據(jù),超越了多年來這個(gè)領(lǐng)域一直使用的、缺乏靈活性的全基因組水平分析方式!
表觀遺傳修飾在農(nóng)業(yè)應(yīng)用方面,也影響植物和動(dòng)物性狀發(fā)展。明尼蘇達(dá)大學(xué)微生物和植物基因組學(xué)研究所所長(zhǎng)Nathan Springer博士是NimbleGen另一位重要合作者,說到:“在人類基因研究以外的定向亞硫酸氫鹽測(cè)序中,NimbleGen公司的技術(shù)具有獨(dú)特的優(yōu)勢(shì),它可顯著提高農(nóng)業(yè)基因組學(xué)研究的效率和降低實(shí)驗(yàn)成本。”
羅氏NimbleGen公司總裁Rebecca Selzer博士說: “我們非常高興能夠通過與表觀遺傳學(xué)研究領(lǐng)域領(lǐng)先的科學(xué)家合作,推出這個(gè)新的產(chǎn)品系列,為表觀遺傳學(xué)研究提供新工具。這將是另一個(gè)成功,即利用NimbleGen的技術(shù)幫助科研人員開發(fā)更好的研究方法、獲得更有意義的發(fā)現(xiàn)。”
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