安捷倫科技將 CGH 和 SNP 分析結(jié)合到同一芯片上,創(chuàng)造出一款獨(dú)具特色的細(xì)胞遺傳學(xué)工具
2010 年 10 月 11 日,加利福尼亞州圣克拉拉市——安捷倫科技公司(紐約證交所:A)隆重推出 SurePrint G3 Human CGH+SNP 芯片平臺(tái),這一創(chuàng)新型的系統(tǒng)能夠同時(shí)分析染色體拷貝數(shù)改變和不改變的染色體畸變。該系統(tǒng)可以幫助科研人員研究發(fā)育性疾病以及多種癌癥的遺傳機(jī)理。這是目前市場(chǎng)上唯一檢測(cè)雜合性丟失和單親二倍體(LOH/UPD)的雙色 CGH 分析平臺(tái),分辨率可達(dá) 5 至 10兆堿基。
貝勒醫(yī)學(xué)院分子人類遺傳學(xué)系主任 Arthur Beaudet 博士說,“我們終于擁有一款芯片,它不僅具有最佳的拷貝數(shù)檢測(cè)能力,可以覆蓋所有外顯子,而且還具有 SNP 分析能力,可以檢測(cè)由 UPD 或近親結(jié)婚引起的雜合性缺失(LOH)。”
安捷倫 CGH 芯片產(chǎn)品經(jīng)理 Anniek De Witte 表示,“我們將 SNP 探針加入到已經(jīng)被廣泛使用的安捷倫CGH 芯片設(shè)計(jì)中,開發(fā)出一款可以同時(shí)有效檢測(cè)拷貝數(shù)變化及無拷貝數(shù)變化的 LOH/UPD 的強(qiáng)大工具,進(jìn)而獲得更詳細(xì)和完整的基因組畸變圖譜,對(duì)此我們相當(dāng)興奮。相比我們以前推出的 CGH 芯片,這一新產(chǎn)品的分辨率、準(zhǔn)確性和靈敏度同樣出色,絕不會(huì)讓研究者失望。”
安捷倫 SurePrint G3 CGH+SNP 芯片提供目錄版和定制版,與我們目前的芯片形式類似。您可通過安捷倫免費(fèi)的eArray在線工具或eArray XD 單機(jī)版輕松完成定制芯片的設(shè)計(jì)。
SurePrint CGH+SNP 4x180K 和 2x400K 兩款型號(hào)的芯片均可檢測(cè)大約 60000 個(gè) SNP,因此,檢測(cè)整個(gè)基因組的 LOH/UPD 時(shí)分辨率可達(dá)到約 5 至 10 兆堿基。4x180K芯片上的約 120000 個(gè) CGH 探針,由包括細(xì)胞遺傳學(xué)芯片國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)聯(lián)合會(huì) (ISCA, http://isca.genetics.emory.edu) 推薦的8x60K 檢測(cè)芯片中所有的探針以及額外的 60000 個(gè)骨架探針組成。2x400K 芯片上的約 300000 個(gè) CGH 探針覆蓋了基因組最重要的區(qū)域,側(cè)重于基因和外顯子。
SurePrint G3 CGH+SNP 芯片使用與現(xiàn)有的CGH單一檢測(cè)芯片相同的高通量工作流程,因此能夠簡(jiǎn)單高效地應(yīng)用于細(xì)胞遺傳學(xué)研究。安捷倫的Genomic Workbench軟件采用創(chuàng)新算法,利用 CGH 探針計(jì)算拷貝數(shù)變化,通過 SNP 探針測(cè)定等位基因特異性拷貝數(shù)以及定位 LOH/UPD 區(qū)域,彌補(bǔ)了現(xiàn)有芯片分析的不足。該軟件可以同時(shí)分析 CGH 和 SNP 數(shù)據(jù),計(jì)算QC參數(shù),并以此確保高可信度的數(shù)據(jù)評(píng)估。
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安捷倫科技公司(紐約證交所:A)是全球領(lǐng)先的測(cè)量公司,是化學(xué)分析、生命科學(xué)、電子和通信領(lǐng)域的技術(shù)領(lǐng)導(dǎo)者。公司的 18,500 名員工在 100 多個(gè)國(guó)家為客戶服務(wù)。在 2009 財(cái)政年度,安捷倫的業(yè)務(wù)凈收入為 45 億美元。要了解更多安捷倫科技的信息,請(qǐng)?jiān)L問: