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芯片靶向捕獲和重測序技術(shù)加快新一代測序速度

瀏覽次數(shù):4430 發(fā)布日期:2009-7-24  來源:本站 本站原創(chuàng),轉(zhuǎn)載請注明出處

北京2009年7月--來自冷泉港實驗室(CSHL)和安捷倫科技公司(NYSE: A)的研究小組,共同開發(fā)了針對新一代大規(guī)模平行DNA測序技術(shù)的補充方案,使用定制芯片對感興趣的基因組區(qū)域進行靶向捕獲。該方法發(fā)表在Nature Protocols (vol.4, No.6)上,從芯片捕獲到Illumina Genome Analyzer的分析,通常只須9到10天即可完成。

“通過定制芯片上的雜交選擇進行靶向重測序,為解決眾多遺傳問題(包括腫瘤遺傳學)提供了直接而經(jīng)濟的策略,”論文的第一作者, CSHL研究員Emily Hodges博士說,“便捷的芯片,結(jié)合現(xiàn)成的試劑,構(gòu)成了一個便于使用的重測序平臺,可針對研究者各自感興趣的課題重新配置。 ”

“我們很榮幸能與CSHL Gregory Hannon博士的實驗室合作,”合作作者,安捷倫生命科學部 Andy Bhattacharjee博士說,“芯片捕獲技術(shù)簡便、適用性好、耐用性高,有效解決了新一代測序在樣品制備上存在的瓶頸問題。而且,芯片設(shè)計具有高度的可定制性和簡便性,可適用于對其它已知序列真核生物基因組進行靶向捕獲!

閱讀全文,“Hybrid selection of discrete genomic intervals on custom-designed microarrays for massively parallel sequencing”可鏈接 www.nature.com/nprot/journal/v4/n6/full/nprot.2009.68.html (需訂閱)。



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