美國應(yīng)用生物系統(tǒng)公司推出人全基因組范圍的成套SNP基因分型和基因表達(dá)定量分析試劑盒
瀏覽次數(shù):6200 發(fā)布日期:2002-7-20
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美國加州2002年7月10日消息,美國應(yīng)用生物系統(tǒng)公司今天宣布正式推出基于人類基因組信息的最完整的包括生物信息的全套人類基因組分析試劑,這是全球第一個(gè)基于人類基因組信息的商業(yè)化成套試劑產(chǎn)品線。 她的基因信息來源包含了人類基因組的公共數(shù)據(jù)庫和Celera公司的商業(yè)化數(shù)據(jù)庫。Assays-on-Demand基因組分析產(chǎn)品的數(shù)據(jù)庫來源包括:Celera基因組公司、國際SNP合作組織(TSC)、美國國家生物信息中心(NCBI)和日本國家SNP數(shù)據(jù)庫(JSNP)。
Assays-on-Demand基因組分析產(chǎn)品系列中的每一個(gè)分析試劑盒均經(jīng)過活性測試,保證拿來就可以使用。她也是美國Applera公司2001年7月提出的新一輪人類基因組再測序研究項(xiàng)目的第一個(gè)商業(yè)化產(chǎn)品。 本次公布的試劑盒包括77,000個(gè)SNP位點(diǎn)基因分型試劑盒和4400個(gè)基因表達(dá)定量分析試劑盒,全部采用美國應(yīng)用生物系統(tǒng)公司強(qiáng)大的生物信息學(xué)軟件和嚴(yán)格的流程進(jìn)行設(shè)計(jì)。 每一個(gè)基因或SNP位點(diǎn)其靶基因序列均經(jīng)過嚴(yán)格挑選和質(zhì)量控制流程,以保證分析的高特異性和結(jié)果的優(yōu)化。在以后的幾個(gè)月內(nèi),公司還將陸續(xù)推出更多的SNP基因分型和基因表達(dá)定量分析試劑盒,終極目標(biāo)是提供覆蓋人類全基因組的SNP分析試劑盒和針對人類所有基因包括每一個(gè)基因的不同剪接子在內(nèi)的定量表達(dá)分析試劑盒。
“通過整合人類基因組計(jì)劃的人類基因序列數(shù)據(jù)和2001年7月啟動(dòng)的Applera公司人基因組再測序項(xiàng)目的序列信息,美國應(yīng)用生物系統(tǒng)公司的知識產(chǎn)品正在為廣大科學(xué)家提供高信息含量的產(chǎn)品和技術(shù)服務(wù),這些產(chǎn)品將使科學(xué)家的工作方式產(chǎn)生革命性的變化”,美國應(yīng)用生物系統(tǒng)公司總裁Michael W. Hunkapiller說:“美國應(yīng)用生物系統(tǒng)公司提供的Assay on Demand基因組分析系列產(chǎn)品將大大加速科學(xué)發(fā)現(xiàn)的步伐,使科學(xué)家們能夠在幾天或幾個(gè)星期內(nèi)達(dá)到他們的研究目標(biāo),而不是數(shù)月或數(shù)年。這些成套的試劑盒也是實(shí)現(xiàn)個(gè)體化用藥的重要工具,將使臨床藥物治療可以針對每一個(gè)病人的個(gè)體差異”
全球多家第一流的大學(xué)研究所和生物技術(shù)公司參與了自2002年春季開始的Assay on Demand商業(yè)化計(jì)劃,德國基爾的Christian-Albrechts大學(xué)就是其中之一。 該大學(xué)的Stefan Schreiber教授說:“我們使用這套試劑盒進(jìn)行系統(tǒng)性疾病相關(guān)研究,我們已經(jīng)有效地確定了炎癥性結(jié)腸炎、良性淋巴肉芽腫,牛皮癬和牙周潰壞病相關(guān)的基因點(diǎn)突變。有了這些現(xiàn)成的成套SNP分析試劑盒,我們可以在幾個(gè)月內(nèi)完成超過150萬個(gè)SNP分析的結(jié)果。再也不用象過去那樣,花好幾個(gè)月的時(shí)間分析整理基因組數(shù)據(jù),設(shè)計(jì)、測試以及優(yōu)化實(shí)驗(yàn)。
Assay on Demand基因表達(dá)定量分析試劑盒
業(yè)已商業(yè)化的4400種定量基因表達(dá)分析試劑盒可以用于藥靶基因的鑒定、疾病表征,疾病分類,生化通路解析,藥物代謝,基因功能研究以及驗(yàn)證用基因芯片技術(shù)研究人類疾病與藥物開發(fā)研究中得到的相關(guān)數(shù)據(jù)。第一套單反應(yīng)管優(yōu)化的Assays-on-Demand 基因定量分析試劑盒將包括美國國家生物信息中心(NCBI)人類轉(zhuǎn)錄基因標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)庫中業(yè)已研究確定的超過15,000 種人類基因。用戶可以通過基因名稱,基因代碼,RefSeq or GenBank 中的數(shù)字代碼,基因功能分類和其他的標(biāo)志符來挑選基因表達(dá)分析試劑盒。公司將會推出更多的基因表達(dá)分析試劑盒。更多的信息可在www.appliedbiosystems.com上查詢。
Assay on Demand SNP基因分型試劑盒
77000個(gè)SNP分析試劑盒每一個(gè)均經(jīng)過活性測試因此可以直接使用,可以采用候選基因相關(guān)性、候選基因區(qū)域相關(guān)性、連鎖分析和連鎖不平衡研究進(jìn)行疾病研究。每個(gè)SNP基因分型試劑均包含已分析過的兩大人群共90個(gè)個(gè)體的DNA樣本的SNP分型結(jié)果。這一信息可以用于驗(yàn)證每一試劑盒的功效,決定各位點(diǎn)等位基因的頻率,這一點(diǎn)對于致病基因的定位非常重要。 客戶可通過NCBI基因或者單核苷酸多態(tài)性的參考代碼、基因名稱/記號/家族、各SNP在基因組中的位置、與STR標(biāo)記位點(diǎn)的相關(guān)性、單核苷酸多態(tài)性類型和等位基因頻度等來選擇相應(yīng)的SNP分析試劑盒。這些SNP分型試劑盒組成了一個(gè)高分辨并且以功能基因?yàn)橹行牡亩ㄎ粯?biāo)記圖譜,將疾病研究,侯選藥物選擇和藥物療效研究關(guān)聯(lián)研究的有利工具。
單一堿基序列多態(tài)性(SNPs)的發(fā)生頻率為每100-300個(gè)堿基存在一個(gè)SNP位點(diǎn)(包括編碼區(qū)和非編碼區(qū)), SNPs是人類DNA序列變異的主要表現(xiàn)形式。. 盡管SNPs的研究工作仍在進(jìn)行中, 但它對于藥物發(fā)現(xiàn)、臨床藥物試驗(yàn)、生物醫(yī)藥研究以及臨床診斷應(yīng)用中極具價(jià)值,前景無限。 在未來的幾個(gè)月內(nèi),會有更多的經(jīng)過驗(yàn)證的SNPs基因分型試劑盒發(fā)布。ABI公司設(shè)計(jì)在每一個(gè)人類基因上會有3個(gè)以上的SNP分析試劑盒并且在人基因組上每隔10kb將會有一個(gè)SNP分析試劑盒。更多的信息可檢索www.allsnps.com。
產(chǎn)品組成
每一個(gè)基因組分析試劑盒均為ABI Prism 7900HT,7700和7000熒光定量PCR儀優(yōu)化。這些現(xiàn)成的分析試劑盒可以為客戶提供高精確性高重現(xiàn)性的數(shù)據(jù),并且使研究者能更快、更簡便且更經(jīng)濟(jì)地掃描更多的靶目標(biāo)。
美國應(yīng)用生物系統(tǒng)公司知識產(chǎn)品業(yè)務(wù)
2002年4月22日,美國應(yīng)用生物系統(tǒng)公司成為賽來拉公司在線發(fā)現(xiàn)平臺的唯一發(fā)行者。此外,美國應(yīng)用生物系統(tǒng)公司知識產(chǎn)品業(yè)務(wù)還整合了其它基因組數(shù)據(jù)庫的數(shù)據(jù)。知識產(chǎn)品業(yè)務(wù)通過提供信息量豐富的產(chǎn)品和優(yōu)質(zhì)的服務(wù),幫助客戶改進(jìn)研究試驗(yàn)流程,為生命科學(xué)界客戶創(chuàng)造更多的價(jià)值。除了提供成套分析試劑盒以外,知識產(chǎn)品業(yè)務(wù)還提供幫助客戶設(shè)計(jì)引物探針服務(wù)(Assays-by-design),由客戶提供靶序列,ABI公司使用公司獨(dú)有的軟件為客戶的特定序列設(shè)計(jì)以及合成適宜的引物和探針。
詳盡的網(wǎng)上訂貨電子商務(wù)系統(tǒng)
成套分析試劑盒可通過ABI公司的網(wǎng)上商店進(jìn)行直接訂購:http://store.appliedbiosystems.com/. 與賽來拉公司共同合作開發(fā)的網(wǎng)上訂購平臺提供了非常有效的檢索功能,方便研究者快速找到與他們的研究相關(guān)的分析試劑盒。 檢索選項(xiàng)包括:關(guān)鍵字、染色體位置、分子功能以及基因標(biāo)識符批量檢索(可同時(shí)檢索多個(gè)靶序列)。 客戶可獲得靶序列在賽來拉數(shù)據(jù)庫、美國國家生物信息中心數(shù)據(jù)庫的ID信息以及試劑ID的信息,還有其它相關(guān)的生物學(xué)信息,并且檢索均是免費(fèi)的。所有試劑盒都配有一個(gè)2維的條形碼作為識別根據(jù),試劑盒可以成套訂購也可單個(gè)訂購。一旦有新的試劑盒面市,都會添加到網(wǎng)上商店里。
在網(wǎng)站的“About Us”欄位里,點(diǎn)擊“Press Kit”,即可找到成套分析試劑盒的產(chǎn)品單頁和動(dòng)態(tài)介紹。動(dòng)態(tài)介紹也可從http://www.newstream.com/下載。